TTC39B基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

TTC39B编码一种含四肽重复结构域的蛋白,参与脂质代谢调控,与高密度脂蛋白胆固醇水平相关。

基因信息卡

基因符号 TTC39B
基因全名 tetratricopeptide repeat domain 39B
基因类型 protein-coding
染色体位置 9p22.3
NCBI Gene ID 55828 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55828
Ensembl ID ENSG00000165280
UniProt ID Q5VZK9
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:23739
基因别名 DKFZp434B044, FLJ12684, MGC138160

基因功能与研究简介

TTC39B基因编码含有四肽重复结构域(TPR)的蛋白质,该结构域介导蛋白质-蛋白质相互作用。研究表明TTC39B参与脂质代谢调控,影响高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平。全基因组关联研究(GWAS)发现TTC39B基因变异与HDL-C水平相关。此外,TTC39B可能参与细胞周期调控和肿瘤发生,但具体机制尚需进一步研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
高密度脂蛋白胆固醇水平异常 TTC39B基因变异影响HDL-C水平,可能通过调节脂质代谢相关蛋白的相互作用 GWAS研究证据(PMID: 19060906, 20686565)
癌症(潜在关联) TTC39B在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤发生,但机制未明 表达谱研究(PMID: 21746880)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
脂肪组织 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨骼肌 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
3T3-L1 暂无可靠数据 小鼠脂肪细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs581080 SNP 常见变异 与HDL-C水平相关(GWAS)
rs497830 SNP 常见变异 与HDL-C水平相关(GWAS)
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0005634 nucleus

相关通路

暂无可靠数据

蛋白质功能简介

TTC39B蛋白含有四肽重复结构域(TPR),该结构域通常介导蛋白质-蛋白质相互作用。研究表明TTC39B可能参与脂质代谢的调控,但其具体分子机制尚不明确。在细胞中,TTC39B定位于细胞质和细胞核,可能参与多种细胞过程。

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