TULP3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TULP3是纤毛形成和信号转导的关键调控因子,其突变与多种纤毛病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TULP3 |
|---|---|
| 基因全名 | TUB like protein 3 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 12p13.33 |
| NCBI Gene ID | 7289 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7289 |
| Ensembl ID | ENSG00000004700 |
| UniProt ID | Q9Y2K1 |
| OMIM ID | 604730 |
| HGNC ID | 12425 |
| 基因别名 | TUBL3 |
基因功能与研究简介
TULP3(TUB like protein 3)是Tubby蛋白家族成员,在纤毛形成和信号转导中发挥关键作用。TULP3定位于初级纤毛,通过其C端结构域与IFT-A复合物相互作用,调控纤毛内蛋白运输。TULP3还参与Hedgehog信号通路的调控,影响胚胎发育和器官形成。TULP3突变与多种纤毛病相关,如Bardet-Biedl综合征(BBS)和视网膜色素变性。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Bardet-Biedl综合征 | TULP3突变导致纤毛功能异常,影响信号转导,引起多系统发育异常。 | ClinVar |
| 视网膜色素变性 | TULP3突变导致视网膜感光细胞纤毛功能障碍,引起进行性视力丧失。 | OMIM |
| 肥胖 | TULP3突变可能影响下丘脑纤毛信号,导致食欲调节异常。 | ClinVar |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| RPE1 | 暂无可靠数据 | 视网膜色素上皮细胞,常用于纤毛研究 |
| IMCD3 | 暂无可靠数据 | 肾集合管细胞,常用于纤毛研究 |
| MEF | 暂无可靠数据 | 小鼠胚胎成纤维细胞,常用于纤毛研究 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1195C>T (p.Arg399Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,可能影响纤毛定位 |
| c.1498C>T (p.Arg500Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,可能影响IFT-A结合 |
| c.1672C>T (p.Arg558Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,可能影响纤毛形成 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
TULP3功能缺失突变导致纤毛蛋白运输异常,影响Hedgehog信号通路,是纤毛病的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明TULP3存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明TULP3突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005813 (centrosome) |
| • GO:0005929 (cilium) | • GO:0035253 (ciliary membrane) |
| • GO:0042995 (cell projection) | • GO:0060271 (cilium assembly) |
| • GO:0007224 (smoothened signaling pathway) |
相关通路
• Hedgehog signaling pathway (KEGG: hsa04340)
• Cilium assembly (GO:0060271)
蛋白质功能简介
TULP3蛋白包含一个N端的Tubby结构域和一个C端的IFT-A结合区域。TULP3通过其C端与IFT-A复合物相互作用,将特定货物蛋白(如G蛋白偶联受体)运输到纤毛。TULP3在纤毛形成和信号转导中起关键作用,其功能异常导致纤毛病。