U2AF1基因|基因功能、疾病关联、突变与剪接调控研究
U2AF1是RNA剪接关键因子,其突变与骨髓增生异常综合征等血液肿瘤密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | U2AF1 |
|---|---|
| 基因全名 | U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 21q22.3 |
| NCBI Gene ID | 7307 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7307 |
| Ensembl ID | ENSG00000160201 |
| UniProt ID | Q01081 |
| OMIM ID | 191317 |
| HGNC ID | 12453 |
| 基因别名 | U2AF35; U2AFBP; FP793 |
基因功能与研究简介
U2AF1(U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1)编码U2AF复合物的35 kDa亚基,是RNA剪接过程中3'剪接位点识别所必需的关键因子。U2AF1通过其锌指结构域与U2AF2(65 kDa亚基)形成异二聚体,共同识别剪接位点。U2AF1的突变(尤其是S34F和Q157P)常见于骨髓增生异常综合征(MDS)、急性髓系白血病(AML)等髓系肿瘤,导致RNA剪接异常,影响基因表达和细胞分化。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 骨髓增生异常综合征 | U2AF1突变导致RNA剪接异常,影响造血细胞分化,促进疾病发生。 | 已明确致病 |
| 急性髓系白血病 | U2AF1突变在AML中常见,与不良预后相关。 | 已明确致病 |
| 慢性粒单核细胞白血病 | U2AF1突变在CMML中亦有报道,参与疾病发生。 | 具有较强研究证据 |
| 其他髓系肿瘤 | U2AF1突变可见于其他髓系肿瘤,如骨髓增殖性肿瘤。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| K562 | 暂无可靠数据 | 白血病细胞系 |
| HL-60 | 暂无可靠数据 | 白血病细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| S34F | 错义突变 | MDS中约10-15% | 影响锌指结构域,改变剪接位点识别,导致异常剪接 |
| Q157P | 错义突变 | MDS中约5-10% | 影响U2AF1与U2AF2的相互作用,导致剪接异常 |
| 其他突变 | 错义突变 | 少见 | 功能影响待研究 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
部分突变可能导致U2AF1功能丧失,影响剪接,但多数突变可能为功能获得或显性负性效应。
Gain of Function(功能获得,GOF)
S34F等突变可能赋予U2AF1新的剪接识别能力,导致异常剪接,属于功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
突变型U2AF1可能干扰野生型蛋白功能,产生显性负性效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000398 mRNA splicing | • via spliceosome |
| • GO:0005681 spliceosomal complex | • GO:0003723 RNA binding |
| • GO:0008270 zinc ion binding |
相关通路
• hsa03040 Spliceosome
• hsa05202 Transcriptional misregulation in cancer
蛋白质功能简介
U2AF1蛋白是U2AF复合物的35 kDa亚基,包含一个RNA识别基序(RRM)和两个锌指结构域。它识别3'剪接位点的AG二核苷酸,并招募U2 snRNP至分支点。U2AF1突变(如S34F)改变其RNA结合特异性,导致下游基因异常剪接,影响造血分化。
相关产品
| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID | |
|---|---|---|---|---|
| U2AF1L4基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ11704 | 人 | 199746 | 详情 立即询价 |
| U2AF1L4基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ40046 | 人 | 199746 | 详情 立即询价 |
| U2AF1L4基因敲除A549细胞 | EDJ-KQ38775 | 人 | 199746 | 详情 立即询价 |
| U2AF1L4基因敲除Hela细胞 | EDJ-KQ40047 | 人 | 199746 | 详情 立即询价 |
| POU2AF1基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ71140 | 人 | 5450 | 详情 立即询价 |
| POU2AF1基因敲除A549细胞 | EDJ-KQ62672 | 人 | 5450 | 详情 立即询价 |
| POU2AF1基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ50526 | 人 | 5450 | 详情 立即询价 |
| POU2AF1基因敲除Hela细胞 | EDJ-KQ54177 | 人 | 5450 | 详情 立即询价 |
Displaying Records 1 To 8 Of 8 Records