U2SURP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
U2SURP是剪接体组装的重要调控因子,参与U2 snRNP的生物发生,与多种癌症和发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | U2SURP |
|---|---|
| 基因全名 | U2 snRNP-associated SURP domain containing |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3q21.2 |
| NCBI Gene ID | 79633 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79633 |
| Ensembl ID | ENSG00000114544 |
| UniProt ID | Q5T8M2 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:29238 |
| 基因别名 | FLJ22170, MGC131944, U2AF1-RS2, U2AF1L2, U2AF1-RS3 |
基因功能与研究简介
U2SURP基因编码一种含有SURP结构域的蛋白质,该蛋白是U2 snRNP(小核核糖核蛋白)的组成部分,参与前体mRNA剪接的早期步骤。U2SURP在剪接体组装中发挥重要作用,通过与U2 snRNP相关蛋白相互作用,促进U2 snRNP的生物发生和功能。该基因的异常表达或突变可能影响RNA剪接的准确性,进而导致多种疾病的发生。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | U2SURP在多种癌症中表达异常,可能通过影响剪接调控肿瘤相关基因的表达,参与肿瘤发生和发展。 | 较强研究证据 |
| 发育异常 | U2SURP在胚胎发育中表达,可能参与神经管和心脏的发育,其突变可能导致发育异常。 | 潜在关联 |
| 神经退行性疾病 | U2SURP可能通过影响神经元中特定基因的剪接,参与神经退行性疾病的病理过程。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白质结构,导致功能异常 |
| c.567delC (p.Leu189fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 导致蛋白质截短,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致U2SURP蛋白功能丧失或减弱,可能影响剪接体组装,导致剪接异常。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:目前暂无明确证据表明U2SURP存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负效应突变:可能干扰正常U2SURP蛋白的功能,但暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005681 (spliceosomal complex) | • GO:0000398 (mRNA splicing |
| • via spliceosome) | • GO:0003723 (RNA binding) |
| • GO:0005634 (nucleus) |
相关通路
• Spliceosome (hsa03040)
蛋白质功能简介
U2SURP蛋白含有SURP结构域,该结构域介导蛋白质-蛋白质相互作用。U2SURP是U2 snRNP的组分,参与剪接体组装和pre-mRNA剪接。该蛋白在细胞核中定位,与U2 snRNP相关蛋白相互作用,可能参与U2 snRNP的生物发生和稳定性。U2SURP的异常表达或突变可能影响RNA剪接的准确性,进而导致疾病。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|