U2SURP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

U2SURP是剪接体组装的重要调控因子,参与U2 snRNP的生物发生,与多种癌症和发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 U2SURP
基因全名 U2 snRNP-associated SURP domain containing
基因类型 protein-coding
染色体位置 3q21.2
NCBI Gene ID 79633 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79633
Ensembl ID ENSG00000114544
UniProt ID Q5T8M2
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:29238
基因别名 FLJ22170, MGC131944, U2AF1-RS2, U2AF1L2, U2AF1-RS3

基因功能与研究简介

U2SURP基因编码一种含有SURP结构域的蛋白质,该蛋白是U2 snRNP(小核核糖核蛋白)的组成部分,参与前体mRNA剪接的早期步骤。U2SURP在剪接体组装中发挥重要作用,通过与U2 snRNP相关蛋白相互作用,促进U2 snRNP的生物发生和功能。该基因的异常表达或突变可能影响RNA剪接的准确性,进而导致多种疾病的发生。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 U2SURP在多种癌症中表达异常,可能通过影响剪接调控肿瘤相关基因的表达,参与肿瘤发生和发展。 较强研究证据
发育异常 U2SURP在胚胎发育中表达,可能参与神经管和心脏的发育,其突变可能导致发育异常。 潜在关联
神经退行性疾病 U2SURP可能通过影响神经元中特定基因的剪接,参与神经退行性疾病的病理过程。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
K562 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白质结构,导致功能异常
c.567delC (p.Leu189fs) 移码突变 暂无可靠数据 导致蛋白质截短,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致U2SURP蛋白功能丧失或减弱,可能影响剪接体组装,导致剪接异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明U2SURP存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负效应突变:可能干扰正常U2SURP蛋白的功能,但暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005681 (spliceosomal complex) • GO:0000398 (mRNA splicing
• via spliceosome) • GO:0003723 (RNA binding)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

Spliceosome (hsa03040)

蛋白质功能简介

U2SURP蛋白含有SURP结构域,该结构域介导蛋白质-蛋白质相互作用。U2SURP是U2 snRNP的组分,参与剪接体组装和pre-mRNA剪接。该蛋白在细胞核中定位,与U2 snRNP相关蛋白相互作用,可能参与U2 snRNP的生物发生和稳定性。U2SURP的异常表达或突变可能影响RNA剪接的准确性,进而导致疾病。

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