UBE2T基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
UBE2T是范可尼贫血通路的关键E2泛素结合酶,参与DNA交联修复,其突变导致范可尼贫血,并与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | UBE2T |
|---|---|
| 基因全名 | ubiquitin conjugating enzyme E2 T |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q32.1 |
| NCBI Gene ID | 29089 ncbi.nlm.nih.gov/gene/29089 |
| Ensembl ID | ENSG00000177156 |
| UniProt ID | Q9NPD8 |
| OMIM ID | 610538 |
| HGNC ID | 25018 |
| 基因别名 | FANCT; HSPC150; PIG50 |
基因功能与研究简介
UBE2T(ubiquitin conjugating enzyme E2 T)编码泛素结合酶E2 T,是范可尼贫血(FA)通路的核心组分。该酶与FANCL(E3连接酶)协同,将泛素分子转移至FANCD2和FANCI,激活FA通路,从而修复DNA链间交联(ICL)。UBE2T功能缺失导致FA互补组T(FA-T),表现为骨髓衰竭、先天性异常和癌症易感性。此外,UBE2T在多种肿瘤中高表达,与肿瘤进展和不良预后相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 范可尼贫血互补组T | UBE2T纯合或复合杂合突变导致FA-T,表现为骨髓衰竭、发育异常和癌症易感性。机制为FA通路受损,无法修复DNA交联。 | 已明确致病(OMIM 610538) |
| 乳腺癌 | UBE2T在乳腺癌中高表达,可能通过促进细胞增殖和DNA修复增强肿瘤恶性程度。 | 具有较强研究证据(PMID: 29232537) |
| 肝细胞癌 | UBE2T在肝细胞癌中表达上调,与不良预后相关,可能通过激活AKT信号通路促进肿瘤进展。 | 具有较强研究证据(PMID: 29367642) |
| 前列腺癌 | UBE2T在前列腺癌中高表达,可能通过调控雄激素受体信号促进肿瘤生长。 | 潜在关联(PMID: 30530635) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.706C>T (p.Arg236Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.470T>C (p.Leu157Pro) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或活性,导致功能部分丧失 |
| c.1A>G (p.Met1Val) | 起始密码子突变 | 罕见 | 可能影响翻译起始,导致蛋白缺失或功能异常 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失):突变导致UBE2T蛋白活性降低或完全缺失,破坏FA通路,无法修复DNA交联,导致范可尼贫血。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明UBE2T存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明UBE2T突变具有显性负性效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 - ubiquitin-protein transferase activity | • GO:0005515 - protein binding |
| • GO:0005634 - nucleus | • GO:0005654 - nucleoplasm |
| • GO:0006281 - DNA repair | • GO:0006974 - cellular response to DNA damage stimulus |
| • GO:0016567 - protein ubiquitination | • GO:0070531 - histone H2A K63-linked ubiquitination |
相关通路
• Fanconi anemia pathway (hsa03460)
• Ubiquitin mediated proteolysis (hsa04120)
蛋白质功能简介
UBE2T蛋白属于E2泛素结合酶家族,包含保守的UBC结构域。在FA通路中,UBE2T与FANCL形成复合物,催化FANCD2和FANCI的K561和K523位点单泛素化,这是FA通路激活的关键步骤。UBE2T还参与其他DNA修复过程,如跨损伤合成(TLS)。在细胞周期中,UBE2T的表达受细胞周期调控,在S期和G2/M期升高。