UFD1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

UFD1是泛素融合降解途径的关键因子,参与内质网相关降解和细胞应激反应,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 UFD1
基因全名 ubiquitin fusion degradation 1 like (yeast)
基因类型 protein-coding
染色体位置 22q11.21
NCBI Gene ID 7353 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7353
Ensembl ID ENSG00000100285
UniProt ID Q92890
OMIM ID 601754
HGNC ID 12520
基因别名 UBIQUITIN FUSION DEGRADATION PROTEIN 1; UFD1L; UFD1

基因功能与研究简介

UFD1基因编码泛素融合降解蛋白1,是泛素-蛋白酶体系统的重要组成部分。该蛋白与NPLOC4和VCP形成复合物,参与内质网相关降解(ERAD)和泛素化蛋白的降解过程。UFD1在细胞应激反应、DNA损伤修复和细胞周期调控中发挥关键作用。UFD1基因位于22q11.21区域,该区域的缺失与DiGeorge综合征相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
DiGeorge综合征 UFD1基因位于22q11.21区域,该区域的杂合缺失是DiGeorge综合征的主要病因。UFD1的单倍剂量不足可能影响神经嵴细胞发育,导致心脏畸形、面部异常和胸腺发育不全。 已明确致病
精神分裂症 22q11.21缺失是精神分裂症的高危因素,UFD1可能通过影响神经元发育和突触功能参与疾病发生。 具有较强研究证据
癌症 UFD1在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控细胞增殖和凋亡影响肿瘤发生发展。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.287C>T (p.Pro96Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常
22q11.21缺失 拷贝数变异 常见 导致单倍剂量不足,与DiGeorge综合征相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

UFD1的错义突变或缺失可能导致蛋白功能丧失,影响ERAD途径,导致错误折叠蛋白积累。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明UFD1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明UFD1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process
• GO:0006986 response to unfolded protein • GO:0030433 ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process
• GO:0005634 nucleus • GO:0005829 cytosol

相关通路

hsa04120 Ubiquitin mediated proteolysis
hsa04141 Protein processing in endoplasmic reticulum

蛋白质功能简介

UFD1蛋白由307个氨基酸组成,包含一个UBX结构域,参与蛋白质相互作用。该蛋白与NPLOC4和VCP形成复合物,在ERAD中识别泛素化底物并促进其降解。UFD1还参与细胞周期调控和DNA损伤修复,其功能异常与多种疾病相关。

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