UHRF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

UHRF1是表观遗传调控的关键因子,参与DNA甲基化维持和基因沉默,在多种癌症中异常表达,是潜在的药物靶点。

基因信息卡

基因符号 UHRF1
基因全名 ubiquitin like with PHD and ring finger domains 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 19p13.3
NCBI Gene ID 29128 ncbi.nlm.nih.gov/gene/29128
Ensembl ID ENSG00000276043
UniProt ID Q96T88
OMIM ID 607990
HGNC ID 12556
基因别名 Np95; ICBP90; RNF106; hNP95; huNp95; TDRD22

基因功能与研究简介

UHRF1(ubiquitin like with PHD and ring finger domains 1)基因编码一种多结构域蛋白,在表观遗传调控中发挥核心作用。UHRF1蛋白包含一个泛素样结构域(UBL)、一个Tudor结构域、一个PHD指结构域、一个SRA(SET and RING associated)结构域和一个RING指结构域。UHRF1通过识别半甲基化DNA(hemi-methylated DNA)并招募DNA甲基转移酶1(DNMT1),在DNA复制过程中维持CpG甲基化模式。此外,UHRF1还参与组蛋白修饰、基因沉默和细胞周期调控。UHRF1在多种癌症中高表达,与肿瘤发生、发展及不良预后相关,已成为癌症治疗和表观遗传药物研发的潜在靶点。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症(多种类型) UHRF1在多种癌症中高表达,通过维持异常DNA甲基化、抑制肿瘤抑制基因表达、促进细胞增殖和存活,参与肿瘤发生和发展。 已明确致病(癌症相关)
肝细胞癌 UHRF1在肝细胞癌中高表达,与肿瘤侵袭性和不良预后相关,可能通过调控抑癌基因启动子甲基化促进肿瘤进展。 具有较强研究证据
结直肠癌 UHRF1在结直肠癌中表达上调,与肿瘤分期和转移相关,可能通过表观遗传沉默抑癌基因促进肿瘤发生。 具有较强研究证据
乳腺癌 UHRF1在乳腺癌中高表达,与雌激素受体阴性、高增殖指数和不良预后相关,可能通过调控DNA甲基化影响肿瘤生物学行为。 具有较强研究证据
肺癌 UHRF1在非小细胞肺癌中表达升高,与肿瘤生长和转移相关,可能作为预后标志物和治疗靶点。 具有较强研究证据
胃癌 UHRF1在胃癌中高表达,与肿瘤侵袭和淋巴结转移相关,可能通过表观遗传机制促进肿瘤进展。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
胸腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
卵巢 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Trp) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但具体影响需进一步研究
c.456_457insA (p.Leu153fs) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
c.789G>A (p.Trp263Ter) 无义突变 暂无可靠数据 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:导致UHRF1蛋白功能缺失或减弱,可能影响DNA甲基化维持,导致基因组不稳定。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:增强UHRF1的致癌活性,可能促进肿瘤发生。目前尚无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白可能干扰野生型UHRF1的功能,导致表观遗传调控异常。目前尚无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0003677 DNA binding
• GO:0003682 chromatin binding • GO:0008270 zinc ion binding
• GO:0004842 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0005634 nucleus
• GO:0005654 nucleoplasm • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0006325 chromatin organization • GO:0006338 chromatin remodeling
• GO:0006355 regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0006306 DNA methylation • GO:0006974 cellular response to DNA damage stimulus
• GO:0007049 cell cycle • GO:0008283 cell population proliferation
• GO:0016567 protein ubiquitination • GO:0031490 chromatin DNA binding
• GO:0042802 identical protein binding • GO:0045892 negative regulation of transcription
• DNA-templated • GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• GO:0051276 chromosome organization • GO:0071158 positive regulation of cell cycle arrest
• GO:1901796 regulation of signal transduction by p53 class mediator

相关通路

DNA methylation
Epigenetic regulation of gene expression
Cell cycle
p53 signaling pathway
Ubiquitin mediated proteolysis

蛋白质功能简介

UHRF1蛋白是一种多结构域蛋白,包含UBL、Tudor、PHD、SRA和RING指结构域。它通过SRA结构域识别半甲基化DNA,并招募DNMT1至复制叉,从而在DNA复制过程中维持CpG甲基化。UHRF1还通过PHD和Tudor结构域识别组蛋白H3K9me3,参与异染色质形成和基因沉默。此外,UHRF1具有E3泛素连接酶活性,可泛素化底物蛋白,调控其稳定性。UHRF1在细胞周期调控、DNA损伤应答和肿瘤抑制中发挥重要作用。

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