ULK3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ULK3是一种丝氨酸/苏氨酸激酶,参与自噬调控、Hedgehog信号通路及细胞增殖,与多种癌症和发育过程相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ULK3 |
|---|---|
| 基因全名 | unc-51 like kinase 3 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 15q24.1 |
| NCBI Gene ID | 25989 ncbi.nlm.nih.gov/gene/25989 |
| Ensembl ID | ENSG00000140474 |
| UniProt ID | Q6PHR2 |
| OMIM ID | 613955 |
| HGNC ID | 19707 |
| 基因别名 | DKFZp434H2227, FLJ90586, MGC126562 |
基因功能与研究简介
ULK3(unc-51 like kinase 3)是ULK家族成员之一,编码一种丝氨酸/苏氨酸激酶。该蛋白参与自噬调控、Hedgehog信号通路以及细胞增殖和分化。ULK3在多种组织中表达,尤其在睾丸和胎盘中水平较高。研究表明ULK3在癌症中可能发挥双重作用,既可作为肿瘤抑制因子,也可在某些情况下促进肿瘤进展。此外,ULK3还参与纤毛形成和细胞周期调控。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | ULK3在多种癌症中表达异常,可能通过调控自噬和Hedgehog信号通路影响肿瘤发生发展。 | 较强研究证据 |
| 发育异常 | ULK3参与Hedgehog信号通路,该通路异常与多种发育缺陷相关。 | 潜在关联 |
| 神经退行性疾病 | ULK3参与自噬调控,自噬异常与神经退行性疾病相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 胎盘 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响激酶活性 |
| c.567C>T (p.Arg189Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.890_891del (p.Glu297fs) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,可能导致ULK3激酶活性降低或蛋白截短,影响自噬和Hedgehog信号通路。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变,可能增强ULK3激酶活性,促进细胞增殖或异常信号传导。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变,可能干扰正常ULK3功能,影响自噬或信号通路。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004672 (protein kinase activity) | • GO:0005524 (ATP binding) |
| • GO:0006914 (autophagy) | • GO:0007224 (smoothened signaling pathway) |
| • GO:0005813 (centrosome) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
相关通路
• Autophagy
• Hedgehog signaling pathway
蛋白质功能简介
ULK3蛋白是一种丝氨酸/苏氨酸激酶,属于ULK家族。它包含N端激酶结构域和C端DUF3545结构域。ULK3在自噬中作为自噬相关蛋白复合物的组成部分,参与自噬体的形成。此外,ULK3还参与Hedgehog信号通路,通过磷酸化SUFU调节Gli转录因子的活性。ULK3在细胞增殖、分化和纤毛形成中发挥作用。