UMPS基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

UMPS基因编码尿苷一磷酸合成酶,是嘧啶从头合成途径的关键酶,其缺陷可导致乳清酸尿症。

基因信息卡

基因符号 UMPS
基因全名 uridine monophosphate synthetase
基因类型 protein-coding
染色体位置 3q21.2
NCBI Gene ID 7372 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7372
Ensembl ID ENSG00000114491
UniProt ID P11172
OMIM ID 613891
HGNC ID 12514
基因别名 OMPdecase, UMP synthase, OPRT, UMPS

基因功能与研究简介

UMPS基因编码尿苷一磷酸合成酶,该酶是一种双功能酶,包含乳清酸磷酸核糖转移酶(OPRT)和乳清苷酸脱羧酶(ODC)活性,催化嘧啶从头合成途径中最后两步反应,将乳清酸转化为尿苷一磷酸(UMP)。UMPS在细胞增殖和核酸合成中发挥关键作用,其缺陷可导致乳清酸尿症,一种常染色体隐性遗传病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳清酸尿症 UMPS基因突变导致酶活性降低或缺失,使乳清酸在体内积累,经尿液排出,并引起尿路梗阻、巨幼细胞性贫血和发育迟缓。 已明确致病
结直肠癌 部分研究表明UMPS表达水平与结直肠癌的预后相关,但具体机制尚不明确。 潜在关联
胰腺癌 UMPS在胰腺癌中表达上调,可能参与肿瘤代谢,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
小肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HCT116 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.496A>G (p.Thr166Ala) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响酶活性,与乳清酸尿症相关
c.638G>A (p.Arg213His) 错义突变 暂无可靠数据 导致酶活性降低,与乳清酸尿症相关
c.1024C>T (p.Arg342Ter) 无义突变 暂无可靠数据 导致截短蛋白,功能丧失,与乳清酸尿症相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能丧失型突变):导致UMPS酶活性降低或缺失,影响嘧啶合成,如乳清酸尿症相关突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明UMPS存在此类突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明UMPS存在此类突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004588 (orotate phosphoribosyltransferase activity) • GO:0004590 (orotidine-5'-phosphate decarboxylase activity)
• GO:0006207 (de novo pyrimidine nucleobase biosynthetic process) • GO:0006221 (pyrimidine nucleotide biosynthetic process)
• GO:0005829 (cytosol)

相关通路

Pyrimidine metabolism (hsa00240)
Metabolic pathways (hsa01100)

蛋白质功能简介

UMPS蛋白由480个氨基酸组成,分子量约52 kDa。该蛋白包含两个功能域:N端的OPRT域和C端的ODC域。OPRT催化乳清酸与磷酸核糖焦磷酸反应生成乳清苷酸,ODC催化乳清苷酸脱羧生成UMP。UMPS在细胞质中发挥作用,是嘧啶从头合成途径的限速酶之一。

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