UPF2基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
UPF2是无义介导的mRNA降解(NMD)通路的核心调控因子,对维持转录组稳态和防止异常蛋白产生至关重要。
基因信息卡
| 基因符号 | UPF2 |
|---|---|
| 基因全名 | UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10p14 |
| NCBI Gene ID | 10719 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10719 |
| Ensembl ID | ENSG00000151461 |
| UniProt ID | Q9HAU5 |
| OMIM ID | 605705 |
| HGNC ID | 12612 |
| 基因别名 | RENT2, UPF2, hUPF2 |
基因功能与研究简介
UPF2基因编码无义介导的mRNA降解(NMD)通路中的一个关键调控因子。该蛋白与UPF1和UPF3形成复合物,识别含有提前终止密码子的mRNA并触发其降解,从而防止截短蛋白的产生。UPF2在维持转录组稳态、调控基因表达和应对细胞应激中发挥重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 精神发育迟滞 | UPF2突变可能导致NMD通路功能异常,影响神经发育,但具体机制尚在研究中。 | ClinVar |
| 癌症 | UPF2表达异常与多种癌症相关,可能通过影响NMD活性促进肿瘤发生。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但致病性未明确 |
| c.567del (p.Gln189fs) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如移码突变或提前终止密码子,导致UPF2蛋白功能缺失,影响NMD通路。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000184 - nuclear-transcribed mRNA catabolic process | • nonsense-mediated decay |
| • GO:0005515 - protein binding | • GO:0005634 - nucleus |
| • GO:0005737 - cytoplasm |
相关通路
• Nonsense-Mediated Decay (NMD) - Reactome: R-HSA-927802
蛋白质功能简介
UPF2蛋白是NMD通路的核心组件,包含MIF4G结构域和UPF1结合区域。它桥接UPF1和UPF3,促进NMD复合物的组装。UPF2在细胞质中与核糖体结合,识别异常mRNA并启动降解。其表达水平受细胞应激和发育信号调控。
相关产品
| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|