UPF2基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

UPF2是无义介导的mRNA降解(NMD)通路的核心调控因子,对维持转录组稳态和防止异常蛋白产生至关重要。

基因信息卡

基因符号 UPF2
基因全名 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay
基因类型 protein-coding
染色体位置 10p14
NCBI Gene ID 10719 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10719
Ensembl ID ENSG00000151461
UniProt ID Q9HAU5
OMIM ID 605705
HGNC ID 12612
基因别名 RENT2, UPF2, hUPF2

基因功能与研究简介

UPF2基因编码无义介导的mRNA降解(NMD)通路中的一个关键调控因子。该蛋白与UPF1和UPF3形成复合物,识别含有提前终止密码子的mRNA并触发其降解,从而防止截短蛋白的产生。UPF2在维持转录组稳态、调控基因表达和应对细胞应激中发挥重要作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
精神发育迟滞 UPF2突变可能导致NMD通路功能异常,影响神经发育,但具体机制尚在研究中。 ClinVar
癌症 UPF2表达异常与多种癌症相关,可能通过影响NMD活性促进肿瘤发生。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但致病性未明确
c.567del (p.Gln189fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变或提前终止密码子,导致UPF2蛋白功能缺失,影响NMD通路。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000184 - nuclear-transcribed mRNA catabolic process • nonsense-mediated decay
• GO:0005515 - protein binding • GO:0005634 - nucleus
• GO:0005737 - cytoplasm

相关通路

Nonsense-Mediated Decay (NMD) - Reactome: R-HSA-927802

蛋白质功能简介

UPF2蛋白是NMD通路的核心组件,包含MIF4G结构域和UPF1结合区域。它桥接UPF1和UPF3,促进NMD复合物的组装。UPF2在细胞质中与核糖体结合,识别异常mRNA并启动降解。其表达水平受细胞应激和发育信号调控。

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