URM1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
URM1编码泛素相关修饰因子1,参与蛋白质的泛素样修饰(Urmylation),在胁迫应答和细胞稳态中发挥关键作用。
基因信息卡
| 基因符号 | URM1 |
|---|---|
| 基因全名 | ubiquitin related modifier 1 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 9q34.11 |
| NCBI Gene ID | 81605 ncbi.nlm.nih.gov/gene/81605 |
| Ensembl ID | ENSG00000130402 |
| UniProt ID | Q9BTM9 |
| OMIM ID | 616741 |
| HGNC ID | 28178 |
| 基因别名 | UBIQUITIN-RELATED MODIFIER 1 HOMOLOG; URM1 |
基因功能与研究简介
URM1基因编码泛素相关修饰因子1(Ubiquitin-related modifier 1),是一种类泛素蛋白(UBL),通过其C端甘氨酸与靶蛋白共价结合,参与蛋白质的翻译后修饰(称为Urmylation)。URM1在进化上高度保守,从酵母到人类均存在。在酵母中,URM1参与胁迫应答、细胞周期调控和线粒体功能维持。在人类中,URM1的功能研究相对较少,但已有证据表明其参与细胞应激反应、DNA损伤修复和代谢调控。URM1的异常表达可能与某些癌症和神经退行性疾病相关,但具体机制尚待深入研究。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 暂无明确致病性证据 | 目前尚无URM1基因突变直接导致人类遗传性疾病的明确报道。 | 暂无可靠数据 |
| 癌症(潜在关联) | 有研究表明URM1在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响p53通路或氧化应激反应参与肿瘤发生发展,但证据尚不充分。 | PMID: 25849985 |
| 神经退行性疾病(潜在关联) | URM1可能参与氧化应激和蛋白质稳态调控,与神经退行性疾病的病理过程存在潜在联系,但缺乏直接证据。 | 暂无明确证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| 暂无明确致病性突变 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无明确证据 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变(Loss of Function):可能导致URM1蛋白功能丧失或减弱,影响Urmylation修饰,进而影响细胞应激反应和稳态。目前尚无明确的人类致病性LoF突变报道。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变(Gain of Function):可能导致URM1蛋白获得新的或增强的功能,但目前在URM1中未见明确报道。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变(Dominant Negative):可能干扰正常URM1蛋白的功能,但目前在URM1中未见明确报道。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005829 (cytosol) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0019948 (protein urmylation) | • GO:0006974 (cellular response to DNA damage stimulus) |
| • GO:0006950 (response to stress) |
相关通路
• Urmylation pathway (Ubiquitin-like protein conjugation pathway)
• p53 signaling pathway (potential)
• Oxidative stress response (potential)
蛋白质功能简介
URM1蛋白由101个氨基酸组成,分子量约11 kDa。其结构包含一个泛素样结构域,C端具有保守的甘氨酸残基,用于与底物蛋白形成异肽键。URM1通过其C端甘氨酸与E1激活酶UBA4(MOCS3)结合,形成硫代羧酸中间体,随后转移至靶蛋白的赖氨酸残基。URM1的修饰底物包括一些参与胁迫应答和代谢的蛋白,如过氧化物酶和线粒体蛋白。URM1的修饰过程可逆,去结合酶可能为UCHL1等。URM1在细胞中主要定位于细胞质和细胞核,在应激条件下表达上调。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
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