URM1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

URM1编码泛素相关修饰因子1,参与蛋白质的泛素样修饰(Urmylation),在胁迫应答和细胞稳态中发挥关键作用。

基因信息卡

基因符号 URM1
基因全名 ubiquitin related modifier 1
基因类型 protein coding
染色体位置 9q34.11
NCBI Gene ID 81605 ncbi.nlm.nih.gov/gene/81605
Ensembl ID ENSG00000130402
UniProt ID Q9BTM9
OMIM ID 616741
HGNC ID 28178
基因别名 UBIQUITIN-RELATED MODIFIER 1 HOMOLOG; URM1

基因功能与研究简介

URM1基因编码泛素相关修饰因子1(Ubiquitin-related modifier 1),是一种类泛素蛋白(UBL),通过其C端甘氨酸与靶蛋白共价结合,参与蛋白质的翻译后修饰(称为Urmylation)。URM1在进化上高度保守,从酵母到人类均存在。在酵母中,URM1参与胁迫应答、细胞周期调控和线粒体功能维持。在人类中,URM1的功能研究相对较少,但已有证据表明其参与细胞应激反应、DNA损伤修复和代谢调控。URM1的异常表达可能与某些癌症和神经退行性疾病相关,但具体机制尚待深入研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
暂无明确致病性证据 目前尚无URM1基因突变直接导致人类遗传性疾病的明确报道。 暂无可靠数据
癌症(潜在关联) 有研究表明URM1在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响p53通路或氧化应激反应参与肿瘤发生发展,但证据尚不充分。 PMID: 25849985
神经退行性疾病(潜在关联) URM1可能参与氧化应激和蛋白质稳态调控,与神经退行性疾病的病理过程存在潜在联系,但缺乏直接证据。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HepG2 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
暂无明确致病性突变 暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无明确证据
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变(Loss of Function):可能导致URM1蛋白功能丧失或减弱,影响Urmylation修饰,进而影响细胞应激反应和稳态。目前尚无明确的人类致病性LoF突变报道。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变(Gain of Function):可能导致URM1蛋白获得新的或增强的功能,但目前在URM1中未见明确报道。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变(Dominant Negative):可能干扰正常URM1蛋白的功能,但目前在URM1中未见明确报道。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005829 (cytosol) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0019948 (protein urmylation) • GO:0006974 (cellular response to DNA damage stimulus)
• GO:0006950 (response to stress)

相关通路

Urmylation pathway (Ubiquitin-like protein conjugation pathway)
p53 signaling pathway (potential)
Oxidative stress response (potential)

蛋白质功能简介

URM1蛋白由101个氨基酸组成,分子量约11 kDa。其结构包含一个泛素样结构域,C端具有保守的甘氨酸残基,用于与底物蛋白形成异肽键。URM1通过其C端甘氨酸与E1激活酶UBA4(MOCS3)结合,形成硫代羧酸中间体,随后转移至靶蛋白的赖氨酸残基。URM1的修饰底物包括一些参与胁迫应答和代谢的蛋白,如过氧化物酶和线粒体蛋白。URM1的修饰过程可逆,去结合酶可能为UCHL1等。URM1在细胞中主要定位于细胞质和细胞核,在应激条件下表达上调。

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