USF2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

USF2是一种基本的螺旋-环-螺旋亮氨酸拉链转录因子,调控多种基因表达,参与细胞增殖、代谢和应激反应,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 USF2
基因全名 upstream transcription factor 2, c-fos interacting
基因类型 protein-coding
染色体位置 19q13.32
NCBI Gene ID 7392 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7392
Ensembl ID ENSG00000105698
UniProt ID Q15853
OMIM ID 600416
HGNC ID 12610
基因别名 FIP, bHLHb11, USF2a, USF2b

基因功能与研究简介

USF2(上游转录因子2)属于基本的螺旋-环-螺旋亮氨酸拉链(bHLH-LZ)转录因子家族,能够结合E-box序列(5'-CANNTG-3')调控下游基因表达。USF2参与细胞增殖、分化、代谢、应激反应和免疫调节等多种生物学过程。USF2在多种组织中广泛表达,其功能异常与癌症、代谢性疾病和神经系统疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 USF2在肝细胞癌中表达上调,可能通过调控细胞周期和凋亡相关基因促进肿瘤进展。 较强研究证据
乳腺癌 USF2在乳腺癌中表达异常,可能影响雌激素受体信号通路和细胞增殖。 较强研究证据
2型糖尿病 USF2参与调控葡萄糖代谢相关基因,其变异可能影响胰岛素敏感性。 潜在关联
阿尔茨海默病 USF2可能调控淀粉样前体蛋白(APP)基因表达,与阿尔茨海默病发病相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
胰腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
INS-1 暂无可靠数据 胰岛β细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.574C>T (p.Arg192Trp) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响DNA结合活性
c.820G>A (p.Glu274Lys) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白稳定性
c.1003C>T (p.Arg335Ter) 无义突变 暂无可靠数据 导致截短蛋白,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,使USF2失去转录激活功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

某些错义突变可能增强USF2的转录活性,促进肿瘤相关基因表达。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

突变型USF2可能形成无功能的二聚体,干扰野生型USF2的功能。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006355 (regulation of transcription • DNA-templated)
• GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II)

相关通路

hsa05200 (Pathways in cancer)
hsa04910 (Insulin signaling pathway)
hsa04068 (FoxO signaling pathway)

蛋白质功能简介

USF2蛋白由346个氨基酸组成,包含基本的DNA结合结构域、螺旋-环-螺旋结构域和亮氨酸拉链结构域。USF2以同源二聚体或与USF1形成异源二聚体,结合E-box序列调控基因转录。USF2在细胞核中发挥功能,参与调控细胞周期、凋亡、代谢和应激反应相关基因的表达。

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