USH1C基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
USH1C基因编码harmonin蛋白，是听觉毛细胞和视网膜光感受器细胞中机械电转导的关键组分，其突变导致Usher综合征1型。
基因信息卡
| 基因符号 | USH1C |
|---|---|
| 基因全名 | USH1C (Usher syndrome 1C) |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11p15.1 |
| NCBI Gene ID | 10083 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10083 |
| Ensembl ID | ENSG00000006611 |
| UniProt ID | Q9Y6N9 |
| OMIM ID | 605242 |
| HGNC ID | 12597 |
| 基因别名 | PDZ-73, PDZ73, AIEBP, DFNB18, NY-CO-37, NY-CO-38 |
基因功能与研究简介
USH1C基因编码harmonin蛋白，该蛋白含有PDZ结构域，在听觉毛细胞和视网膜光感受器细胞中表达，参与机械电转导复合物的组装和信号传导。USH1C基因突变是Usher综合征1型（USH1）的病因之一，该病为常染色体隐性遗传，表现为先天性感音神经性耳聋、前庭功能障碍和进行性视网膜色素变性。此外，USH1C突变也可导致非综合征型耳聋DFNB18。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Usher综合征1型 | USH1C基因突变导致harmonin蛋白功能异常，影响毛细胞静纤毛的发育和功能，导致感音神经性耳聋和前庭功能障碍；在视网膜中，影响光感受器细胞的结构和功能，导致视网膜色素变性。 | 已明确致病 |
| 非综合征型耳聋DFNB18 | USH1C基因突变也可导致仅表现为耳聋的非综合征型常染色体隐性遗传耳聋，其致病机制与harmonin蛋白在耳蜗毛细胞中的作用相关。 | 已明确致病 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 耳蜗 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.216G>A (p.Trp72Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.496C>T (p.Arg166Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.238C>T (p.Arg80Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.IVS1+1G>A | 剪接突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.238C>T (p.Arg80Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
USH1C基因的致病突变多为功能缺失型，导致harmonin蛋白截短或降解，丧失正常功能。
Gain of Function（功能获得，GOF）
暂无明确证据表明USH1C突变具有功能获得效应。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
暂无明确证据表明USH1C突变具有显性负效应。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005546 (phosphatidylinositol-4 |
| • 5-bisphosphate binding) | • GO:0005912 (adherens junction) |
| • GO:0005923 (bicellular tight junction) | • GO:0005925 (focal adhesion) |
| • GO:0008092 (cytoskeletal protein binding) | • GO:0016020 (membrane) |
| • GO:0030054 (cell junction) | • GO:0030863 (cortical cytoskeleton) |
| • GO:0032420 (stereocilium) | • GO:0045202 (synapse) |
| • GO:0051015 (actin filament binding) |
相关通路
• Usher syndrome pathway (KEGG: hsa05146)
• Hearing loss pathway (KEGG: hsa05412)
• Retinitis pigmentosa pathway (KEGG: hsa04744)
蛋白质功能简介
harmonin蛋白由USH1C基因编码，含有PDZ结构域，是Usher蛋白复合物的核心成分。该复合物在听觉毛细胞静纤毛和视网膜光感受器细胞中形成，参与机械电转导、细胞极性和突触传递。harmonin蛋白通过与MYO7A、USH1G、CDH23等蛋白相互作用，维持毛细胞静纤毛的结构完整性。其功能缺失导致毛细胞退化，引起耳聋和视网膜变性。
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