USH2A基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
USH2A基因编码Usherin蛋白,是遗传性耳聋和视网膜色素变性(Usher综合征)的重要致病基因。
基因信息卡
| 基因符号 | USH2A |
|---|---|
| 基因全名 | Usherin |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q41 |
| NCBI Gene ID | 7399 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7399 |
| Ensembl ID | ENSG00000042781 |
| UniProt ID | Q75445 |
| OMIM ID | 608400 |
| HGNC ID | 12618 |
| 基因别名 | USH2A, RP39, USH2 |
基因功能与研究简介
USH2A基因编码Usherin蛋白,该蛋白是细胞外基质蛋白,在耳蜗和视网膜中表达,参与维持感觉上皮的结构和功能。USH2A基因突变是Usher综合征II型(USH2)和常染色体隐性遗传性视网膜色素变性(arRP)的主要原因之一。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Usher综合征II型 | USH2A基因突变导致Usherin蛋白功能异常,影响内耳毛细胞和视网膜感光细胞的结构与功能,导致先天性感音神经性耳聋和进行性视网膜色素变性。 | 已明确致病 |
| 常染色体隐性遗传性视网膜色素变性 | USH2A基因突变导致视网膜感光细胞退化,引起夜盲、视野缩小和视力下降。 | 已明确致病 |
| 非综合征性听力损失 | 部分USH2A突变可导致非综合征性听力损失,但证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 耳蜗 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| ARPE-19 | 暂无可靠数据 | 视网膜色素上皮细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2299delG | 移码突变 | 常见于USH2患者 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.2276G>T | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.8559-2A>G | 剪接突变 | 罕见 | 影响mRNA剪接,导致蛋白异常 |
| c.1483C>T | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响待研究 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
USH2A基因突变导致Usherin蛋白功能丧失或减少,是主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明USH2A突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明USH2A突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005576 (extracellular region) | • GO:0007155 (cell adhesion) |
| • GO:0007601 (visual perception) | • GO:0007605 (sensory perception of sound) |
| • GO:0030054 (cell junction) |
相关通路
• 暂无明确Pathway ID,但USH2A参与细胞外基质-受体相互作用和细胞粘附相关通路。
蛋白质功能简介
Usherin蛋白是一种细胞外基质蛋白,含有多个结构域,包括层粘连蛋白G样结构域、纤连蛋白III型结构域和钙结合结构域。它在内耳和视网膜中形成细胞外基质复合物,对感觉上皮的完整性至关重要。