USP17L1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
USP17L1编码去泛素化酶,参与细胞增殖与凋亡调控,与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | USP17L1 |
|---|---|
| 基因全名 | ubiquitin specific peptidase 17 like family member 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 8p23.1 |
| NCBI Gene ID | 401431 ncbi.nlm.nih.gov/gene/401431 |
| Ensembl ID | ENSG00000213988 |
| UniProt ID | Q6ZV65 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | 37116 |
| 基因别名 | USP17L, USP17L1, FLJ38606 |
基因功能与研究简介
USP17L1(ubiquitin specific peptidase 17 like family member 1)编码一种去泛素化酶,属于USP17家族。该酶通过去除底物蛋白上的泛素链,调控蛋白质稳定性,参与细胞增殖、凋亡、DNA损伤修复等过程。研究表明USP17L1在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控MYC、p53等关键蛋白影响肿瘤发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | USP17L1在肝癌组织中高表达,可能通过去泛素化稳定MYC蛋白,促进肿瘤增殖。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | USP17L1在乳腺癌中表达上调,与不良预后相关,可能通过调控p53影响细胞凋亡。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | USP17L1在非小细胞肺癌中高表达,可能通过去泛素化稳定细胞周期蛋白促进增殖。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | USP17L1在结直肠癌中表达升高,可能参与Wnt/β-catenin通路调控。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.456C>T (p.R152W) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响去泛素化酶活性 |
| c.789delC (p.L263fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,失去去泛素化酶活性。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变,如某些错义突变可能增强酶活性或改变底物特异性。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变,可能干扰野生型蛋白功能,但USP17L1中暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity) | • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
相关通路
• hsa04120 (Ubiquitin mediated proteolysis)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
USP17L1蛋白属于去泛素化酶家族,含有UCH催化结构域,能够水解底物蛋白上的泛素链,从而调控底物稳定性。研究表明USP17L1可能通过去泛素化MYC、p53等蛋白,参与细胞增殖和凋亡的调控。在多种肿瘤中表达异常,提示其可能作为潜在的癌基因或治疗靶点。
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