USP18基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
USP18是干扰素信号通路的关键负调控因子,通过去泛素化ISG15调节先天免疫,与多种自身免疫性疾病和病毒感染相关。
基因信息卡
| 基因符号 | USP18 |
|---|---|
| 基因全名 | ubiquitin specific peptidase 18 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 22q11.21 |
| NCBI Gene ID | 11274 ncbi.nlm.nih.gov/gene/11274 |
| Ensembl ID | ENSG00000184979 |
| UniProt ID | Q9UMW8 |
| OMIM ID | 607057 |
| HGNC ID | 12616 |
| 基因别名 | ISG43, UBP43 |
基因功能与研究简介
USP18(ubiquitin specific peptidase 18)编码一种去泛素化酶,属于泛素特异性蛋白酶家族。USP18通过去除ISG15(干扰素刺激基因15)的共价结合,负调控I型干扰素信号通路,从而调节先天免疫应答。USP18在免疫调节、抗病毒防御和自身免疫性疾病中发挥重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 自身免疫性甲状腺炎 | USP18表达异常可能影响干扰素信号,导致自身免疫反应 | 较强研究证据 |
| 系统性红斑狼疮 | USP18在干扰素通路中的负调控作用与SLE的发病机制相关 | 较强研究证据 |
| 病毒感染 | USP18通过调节干扰素信号影响病毒清除,如流感病毒、HIV等 | 较强研究证据 |
| 癌症 | USP18在多种肿瘤中表达异常,可能影响肿瘤免疫微环境 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| Jurkat | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.404C>T (p.Pro135Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或酶活性,功能影响待验证 |
| c.1000G>A (p.Val334Ile) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,需进一步研究 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):导致USP18酶活性降低或丧失,可能增强干扰素信号,与自身免疫病相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明USP18存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明USP18存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005829 (cytosol) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0002376 (immune system process) |
| • GO:0035455 (response to interferon-alpha) | • GO:0035456 (response to interferon-beta) |
相关通路
• Interferon Signaling (Reactome: R-HSA-909733)
• ISG15 antiviral mechanism (Reactome: R-HSA-1169408)
蛋白质功能简介
USP18蛋白由371个氨基酸组成,分子量约43 kDa。它包含一个保守的肽酶C19结构域,具有去泛素化酶活性。USP18主要作为ISG15的特异性蛋白酶,去除ISG15修饰,从而负调控I型干扰素信号。此外,USP18还通过非酶活性机制与IFNAR2结合,抑制干扰素信号。USP18在免疫细胞中高表达,参与调节先天免疫应答。
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