USP21基因|去泛素化酶功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
USP21编码一种去泛素化酶,参与细胞周期调控、DNA损伤修复和炎症信号通路,与多种癌症和自身免疫疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | USP21 |
|---|---|
| 基因全名 | ubiquitin specific peptidase 21 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q23.3 |
| NCBI Gene ID | 27005 ncbi.nlm.nih.gov/gene/27005 |
| Ensembl ID | ENSG00000143149 |
| UniProt ID | Q9UHP3 |
| OMIM ID | 618615 |
| HGNC ID | 12624 |
| 基因别名 | USP16; USP23 |
基因功能与研究简介
USP21(ubiquitin specific peptidase 21)编码一种去泛素化酶,属于泛素特异性蛋白酶家族。该酶通过去除靶蛋白上的泛素链,调控蛋白质的稳定性、活性和亚细胞定位。USP21参与细胞周期调控、DNA损伤修复、炎症信号通路(如NF-κB)以及固有免疫应答。研究表明,USP21在多种癌症中异常表达,影响肿瘤发生发展,并与自身免疫疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | USP21在肝细胞癌中高表达,通过去泛素化稳定β-catenin,激活Wnt信号通路,促进肿瘤增殖和转移。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | USP21在结直肠癌中表达上调,通过去泛素化稳定MYC,促进细胞增殖和肿瘤生长。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | USP21在乳腺癌中高表达,与不良预后相关,可能通过调控ERα稳定性影响肿瘤进展。 | 潜在关联 |
| 系统性红斑狼疮 | USP21参与调控炎症因子表达,可能通过影响NF-κB信号通路参与自身免疫疾病发病。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Ile412Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或底物结合,功能影响尚不明确 |
| c.567C>T (p.Pro189Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响去泛素化酶活性,需进一步验证 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变可能导致USP21酶活性降低或丧失,影响底物去泛素化,导致细胞周期或DNA修复异常。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变可能增强USP21的酶活性或底物亲和力,导致致癌蛋白过度稳定,促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变可能产生无活性的USP21蛋白,干扰野生型蛋白的功能,影响正常细胞过程。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004843 - thiol-dependent deubiquitinase | • GO:0006511 - ubiquitin-dependent protein catabolic process |
| • GO:0005634 - nucleus | • GO:0005737 - cytoplasm |
| • GO:0008283 - cell population proliferation | • GO:0006974 - DNA damage response |
相关通路
• hsa04120 - Ubiquitin mediated proteolysis
• hsa04064 - NF-kappa B signaling pathway
• hsa04310 - Wnt signaling pathway
蛋白质功能简介
USP21蛋白由573个氨基酸组成,包含一个保守的肽酶C19结构域,具有去泛素化酶活性。它通过去除底物上的泛素链,调控多种蛋白质的稳定性,如β-catenin、MYC和ERα。USP21在细胞核和细胞质中均有分布,参与细胞周期、DNA损伤修复和炎症信号通路。其异常表达与多种癌症相关,是潜在的药物靶点。
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