USP35基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
USP35是一种去泛素化酶,参与调控细胞周期、线粒体自噬和DNA损伤修复,与多种癌症和神经退行性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | USP35 |
|---|---|
| 基因全名 | ubiquitin specific peptidase 35 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11q14.2 |
| NCBI Gene ID | 57558 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57558 |
| Ensembl ID | ENSG00000137710 |
| UniProt ID | Q9P2H5 |
| OMIM ID | 615146 |
| HGNC ID | 20066 |
| 基因别名 | FLJ14442 |
基因功能与研究简介
USP35(ubiquitin specific peptidase 35)属于去泛素化酶家族,通过去除靶蛋白上的泛素链,调控蛋白质稳定性、信号转导和细胞周期进程。USP35在多种组织中表达,尤其在睾丸和脑中高表达。研究表明USP35参与线粒体自噬、DNA损伤修复和细胞周期调控,其异常表达与多种癌症(如乳腺癌、肺癌)和神经退行性疾病(如帕金森病)相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | USP35在乳腺癌中高表达,可能通过去泛素化稳定致癌蛋白,促进肿瘤增殖和转移。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | USP35在非小细胞肺癌中表达上调,与不良预后相关,可能通过调控细胞周期和凋亡影响肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 帕金森病 | USP35参与线粒体自噬调控,其功能异常可能导致线粒体损伤积累,与帕金森病发病相关。 | 潜在关联 |
| 其他癌症 | USP35在结直肠癌、肝癌等中也有异常表达,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白稳定性或酶活性 |
| c.567C>T (p.Arg189Trp) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响底物结合 |
| c.890_891del (p.Glu297fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 导致蛋白截短,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致USP35酶活性降低或蛋白降解,可能影响线粒体自噬和DNA损伤修复,增加疾病风险。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:增强USP35去泛素化活性,可能稳定致癌蛋白,促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:突变蛋白可能干扰野生型USP35功能,导致细胞周期异常或凋亡障碍。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004843 - cysteine-type deubiquitinase activity | • GO:0006511 - ubiquitin-dependent protein catabolic process |
| • GO:0005737 - cytoplasm | • GO:0005634 - nucleus |
| • GO:0005829 - cytosol |
相关通路
• hsa04120 - Ubiquitin mediated proteolysis
• hsa04144 - Endocytosis
• hsa04217 - Necroptosis
蛋白质功能简介
USP35蛋白属于去泛素化酶家族,包含一个保守的催化结构域(peptidase C19)和一个锌指结构域。USP35通过去除底物蛋白上的泛素链,调控其稳定性。已知底物包括细胞周期蛋白、线粒体自噬受体等。USP35在细胞周期调控、线粒体质量控制、DNA损伤修复中发挥重要作用。其异常表达或突变与多种疾病相关,是潜在的药物靶点。