USP42基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

USP42编码去泛素化酶,参与细胞周期调控和DNA损伤应答,与多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 USP42
基因全名 ubiquitin specific peptidase 42
基因类型 protein-coding
染色体位置 7p22.1
NCBI Gene ID 84132 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84132
Ensembl ID ENSG00000106346
UniProt ID Q9H9J4
OMIM ID 612645
HGNC ID 20095
基因别名 FLJ31818

基因功能与研究简介

USP42(ubiquitin specific peptidase 42)编码一种去泛素化酶,属于泛素特异性蛋白酶家族。该酶通过去除靶蛋白上的泛素链,调控蛋白质的稳定性、活性和亚细胞定位。USP42参与细胞周期调控、DNA损伤应答和基因表达调控等过程。研究表明,USP42在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响p53等关键蛋白的稳定性参与肿瘤发生发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 USP42在多种癌症中表达异常,可能通过去泛素化p53等肿瘤抑制因子,影响其稳定性,从而促进肿瘤发生。 较强研究证据
暂无明确致病性遗传病 目前尚无USP42突变导致明确遗传病的报道。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
甲状腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
其他组织 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
其他细胞系 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.567delC (p.Leu189fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变可能导致USP42去泛素化酶活性降低,影响底物蛋白的稳定性,从而干扰细胞周期和DNA损伤应答。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前尚无明确证据表明USP42存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

目前尚无明确证据表明USP42存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity) • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0005829 (cytosol)

相关通路

hsa04120 (Ubiquitin mediated proteolysis)
hsa04110 (Cell cycle)
hsa03440 (Homologous recombination)

蛋白质功能简介

USP42蛋白属于肽酶C19家族,包含一个UCH(ubiquitin C-terminal hydrolase)结构域和一个锌指结构域。该蛋白主要定位于细胞核和细胞质,通过去泛素化作用调控底物蛋白的稳定性。研究表明,USP42可去泛素化p53,抑制其降解,从而影响细胞凋亡和细胞周期阻滞。此外,USP42还参与DNA损伤修复过程。

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