USP9X基因|去泛素化酶功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

USP9X编码X连锁的去泛素化酶,调控多种底物蛋白稳定性,参与神经发育、癌症及多种疾病过程。

基因信息卡

基因符号 USP9X
基因全名 Ubiquitin Specific Peptidase 9 X-Linked
基因类型 protein-coding
染色体位置 Xp11.4
NCBI Gene ID 8239 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8239
Ensembl ID ENSG00000124486
UniProt ID Q93008
OMIM ID 300072
HGNC ID 12632
基因别名 DFFRX, FAF, MRXS99F, hFAM

基因功能与研究简介

USP9X基因编码一个X连锁的去泛素化酶,属于泛素特异性蛋白酶家族。该酶通过去除底物蛋白上的泛素链,调控底物的稳定性、活性和亚细胞定位,参与多种细胞过程,包括细胞周期调控、凋亡、自噬、神经发育和突触功能。USP9X在多种组织中表达,尤其在脑中高表达。其功能异常与多种疾病相关,包括X连锁智力障碍、神经发育障碍、癌症等。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
X连锁智力障碍 USP9X突变导致蛋白功能丧失或异常,影响神经元发育和突触可塑性,导致智力障碍。 已明确致病
神经发育障碍 USP9X突变与自闭症谱系障碍、癫痫等神经发育障碍相关,证据来自病例报道和功能研究。 具有较强研究证据
癌症 USP9X在多种癌症中表达异常,通过调控底物蛋白(如MCL1、β-catenin)影响肿瘤发生、进展和耐药。 癌症相关
其他潜在关联 USP9X可能参与代谢疾病、免疫疾病等,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.4567A>G (p.Thr1523Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.7890_7891del (p.Glu2631fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致USP9X蛋白表达减少或活性降低,影响底物去泛素化,导致疾病。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,可能增强USP9X活性或改变底物特异性,但证据有限。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,突变蛋白可能干扰野生型USP9X功能,但证据不足。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity) • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005829 (cytosol) • GO:0005886 (plasma membrane)

相关通路

Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
Autophagy - animal (KEGG: hsa04140)
Apoptosis (KEGG: hsa04210)

蛋白质功能简介

USP9X蛋白是一种去泛素化酶,属于肽酶C19家族。它包含一个催化结构域和多个蛋白相互作用结构域,能够特异性去除底物上的泛素链,从而稳定底物蛋白。USP9X参与调控多种关键蛋白,如MCL1、β-catenin、DVL3等,影响细胞存活、增殖、分化和迁移。在神经系统中,USP9X对突触发育和功能至关重要。

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