UTP3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
UTP3是核糖体生物发生的关键因子,参与小亚基加工体组装,其功能异常与多种疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | UTP3 |
|---|---|
| 基因全名 | UTP3 small subunit processome component |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 4q13.3 |
| NCBI Gene ID | 57050 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57050 |
| Ensembl ID | ENSG00000138668 |
| UniProt ID | Q9NQZ2 |
| OMIM ID | 611199 |
| HGNC ID | 24264 |
| 基因别名 | SAS10, UTP3, CIRH1A, DKFZp586M2122 |
基因功能与研究简介
UTP3基因编码核糖体小亚基加工体(SSU processome)的一个组分,参与核糖体RNA(rRNA)的加工和核糖体小亚基的组装。该蛋白在核仁中定位,与多种蛋白质相互作用,对核糖体生物发生至关重要。UTP3的功能异常可能导致核糖体生物发生障碍,进而影响细胞增殖和分化,与某些发育异常和癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| North American Indian childhood cirrhosis | UTP3基因突变导致核糖体生物发生异常,影响肝细胞功能,导致肝硬化。 | 已明确致病 |
| 肝细胞癌 | UTP3表达异常可能影响核糖体生物发生,促进肿瘤发生。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | UTP3表达上调可能促进肿瘤细胞增殖。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.292C>T (p.Arg98Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与North American Indian childhood cirrhosis相关 |
| c.1123G>A (p.Gly375Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与North American Indian childhood cirrhosis相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
UTP3的错义突变可能导致蛋白功能丧失,影响核糖体生物发生,导致疾病。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明UTP3存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明UTP3突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005730 nucleolus | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0000462 maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA | • 5.8S rRNA |
| • LSU-rRNA) | • GO:0006364 rRNA processing |
| • GO:0032040 small-subunit processome |
相关通路
• Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
• rRNA processing (Reactome: R-HSA-6791226)
蛋白质功能简介
UTP3蛋白是核仁小亚基加工体(SSU processome)的组分,参与核糖体RNA(rRNA)的加工和核糖体小亚基的组装。该蛋白含有多个WD40重复结构域,可能介导蛋白质-蛋白质相互作用。UTP3在核仁中富集,与多种核仁蛋白相互作用,对核糖体生物发生至关重要。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
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