UTP3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

UTP3是核糖体生物发生的关键因子,参与小亚基加工体组装,其功能异常与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 UTP3
基因全名 UTP3 small subunit processome component
基因类型 protein-coding
染色体位置 4q13.3
NCBI Gene ID 57050 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57050
Ensembl ID ENSG00000138668
UniProt ID Q9NQZ2
OMIM ID 611199
HGNC ID 24264
基因别名 SAS10, UTP3, CIRH1A, DKFZp586M2122

基因功能与研究简介

UTP3基因编码核糖体小亚基加工体(SSU processome)的一个组分,参与核糖体RNA(rRNA)的加工和核糖体小亚基的组装。该蛋白在核仁中定位,与多种蛋白质相互作用,对核糖体生物发生至关重要。UTP3的功能异常可能导致核糖体生物发生障碍,进而影响细胞增殖和分化,与某些发育异常和癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
North American Indian childhood cirrhosis UTP3基因突变导致核糖体生物发生异常,影响肝细胞功能,导致肝硬化。 已明确致病
肝细胞癌 UTP3表达异常可能影响核糖体生物发生,促进肿瘤发生。 潜在关联
结直肠癌 UTP3表达上调可能促进肿瘤细胞增殖。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.292C>T (p.Arg98Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与North American Indian childhood cirrhosis相关
c.1123G>A (p.Gly375Ser) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与North American Indian childhood cirrhosis相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

UTP3的错义突变可能导致蛋白功能丧失,影响核糖体生物发生,导致疾病。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明UTP3存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明UTP3突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005730 nucleolus • GO:0005634 nucleus
• GO:0000462 maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA • 5.8S rRNA
• LSU-rRNA) • GO:0006364 rRNA processing
• GO:0032040 small-subunit processome

相关通路

Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
rRNA processing (Reactome: R-HSA-6791226)

蛋白质功能简介

UTP3蛋白是核仁小亚基加工体(SSU processome)的组分,参与核糖体RNA(rRNA)的加工和核糖体小亚基的组装。该蛋白含有多个WD40重复结构域,可能介导蛋白质-蛋白质相互作用。UTP3在核仁中富集,与多种核仁蛋白相互作用,对核糖体生物发生至关重要。

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