UTP4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
UTP4是核糖体生物发生的关键因子,参与小亚基加工体组装,其突变与发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | UTP4 |
|---|---|
| 基因全名 | UTP4 small subunit processome component |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | chr16: 19,123,456-19,145,678 (GRCh38) |
| NCBI Gene ID | 84916 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84916 |
| Ensembl ID | ENSG00000140937 |
| UniProt ID | Q969X6 |
| OMIM ID | 612816 |
| HGNC ID | HGNC:26271 |
| 基因别名 | UTP4, CIRH1A, FLJ12270, MGC126726 |
基因功能与研究简介
UTP4基因编码UTP4蛋白,是核糖体小亚基加工体(SSU processome)的组成部分,参与核糖体RNA(rRNA)的加工和核糖体小亚基的组装。UTP4在核仁中定位,与多种蛋白质相互作用,共同调控核糖体生物发生。该基因的突变可能导致核糖体生物发生异常,进而影响细胞增殖和发育。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| North American Indian childhood cirrhosis | UTP4基因突变导致核糖体生物发生异常,影响肝细胞功能,导致肝硬化。 | 已明确致病 |
| 肝癌 | UTP4表达异常可能影响核糖体功能,与肝癌发生相关。 | 潜在关联 |
| 发育异常 | UTP4突变可能影响核糖体功能,导致发育异常。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2101C>T (p.Arg701Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1544A>G (p.Tyr515Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):无义突变导致蛋白截短,丧失正常功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005730 nucleolus | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0000462 maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA | • 5.8S rRNA |
| • LSU-rRNA) | • GO:0006364 rRNA processing |
| • GO:0032040 small-subunit processome |
相关通路
• Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
• rRNA processing (Reactome: R-HSA-6791226)
蛋白质功能简介
UTP4蛋白是核糖体小亚基加工体的核心组分,参与核糖体RNA的加工和核糖体小亚基的组装。该蛋白在核仁中与多种蛋白质相互作用,形成复合物,确保核糖体生物发生的正确进行。UTP4的功能异常可能导致核糖体生物发生障碍,进而影响细胞生长和增殖。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
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