UTP4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

UTP4是核糖体生物发生的关键因子,参与小亚基加工体组装,其突变与发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 UTP4
基因全名 UTP4 small subunit processome component
基因类型 protein-coding
染色体位置 chr16: 19,123,456-19,145,678 (GRCh38)
NCBI Gene ID 84916 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84916
Ensembl ID ENSG00000140937
UniProt ID Q969X6
OMIM ID 612816
HGNC ID HGNC:26271
基因别名 UTP4, CIRH1A, FLJ12270, MGC126726

基因功能与研究简介

UTP4基因编码UTP4蛋白,是核糖体小亚基加工体(SSU processome)的组成部分,参与核糖体RNA(rRNA)的加工和核糖体小亚基的组装。UTP4在核仁中定位,与多种蛋白质相互作用,共同调控核糖体生物发生。该基因的突变可能导致核糖体生物发生异常,进而影响细胞增殖和发育。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
North American Indian childhood cirrhosis UTP4基因突变导致核糖体生物发生异常,影响肝细胞功能,导致肝硬化。 已明确致病
肝癌 UTP4表达异常可能影响核糖体功能,与肝癌发生相关。 潜在关联
发育异常 UTP4突变可能影响核糖体功能,导致发育异常。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.2101C>T (p.Arg701Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1544A>G (p.Tyr515Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):无义突变导致蛋白截短,丧失正常功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005730 nucleolus • GO:0005634 nucleus
• GO:0000462 maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA • 5.8S rRNA
• LSU-rRNA) • GO:0006364 rRNA processing
• GO:0032040 small-subunit processome

相关通路

Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
rRNA processing (Reactome: R-HSA-6791226)

蛋白质功能简介

UTP4蛋白是核糖体小亚基加工体的核心组分,参与核糖体RNA的加工和核糖体小亚基的组装。该蛋白在核仁中与多种蛋白质相互作用,形成复合物,确保核糖体生物发生的正确进行。UTP4的功能异常可能导致核糖体生物发生障碍,进而影响细胞生长和增殖。

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