VANGL1基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
VANGL1是平面细胞极性通路的关键基因，参与神经管闭合，其突变与神经管缺陷和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | VANGL1 |
|---|---|
| 基因全名 | VANGL planar cell polarity protein 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p11.2 |
| NCBI Gene ID | 81839 ncbi.nlm.nih.gov/gene/81839 |
| Ensembl ID | ENSG00000173218 |
| UniProt ID | Q8TAA9 |
| OMIM ID | 610132 |
| HGNC ID | 15512 |
| 基因别名 | STB2, VANGL1, KITENIN, FLJ10261 |
基因功能与研究简介
VANGL1基因编码Vang样蛋白1，是平面细胞极性（PCP）通路的核心组分，参与调控细胞极性和定向迁移。该蛋白在神经管闭合过程中发挥关键作用，其突变与神经管缺陷（如脊柱裂）相关。此外，VANGL1的异常表达与多种癌症的进展和转移有关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经管缺陷 | VANGL1突变导致PCP信号通路异常，影响神经管闭合，与脊柱裂等神经管缺陷相关。 | 已明确致病 |
| 脊柱裂 | VANGL1基因突变是脊柱裂的遗传风险因素之一，通过破坏PCP信号通路影响神经管发育。 | 已明确致病 |
| 结直肠癌 | VANGL1在结直肠癌中高表达，可能通过促进细胞迁移和侵袭参与肿瘤进展。 | 具有较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | VANGL1表达上调与肝细胞癌的侵袭和转移相关，可能作为预后标志物。 | 具有较强研究证据 |
| 胃癌 | VANGL1在胃癌中表达异常，与肿瘤分期和淋巴结转移相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脊髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.346G>A (p.Asp116Asn) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能，与神经管缺陷相关 |
| c.739C>T (p.Arg247Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能，与神经管缺陷相关 |
| c.1045C>T (p.Arg349Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能，与神经管缺陷相关 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
功能缺失型突变：导致VANGL1蛋白功能丧失或减弱，破坏PCP信号通路，与神经管缺陷相关。
Gain of Function（功能获得，GOF）
功能获得型突变：目前暂无明确证据表明VANGL1存在功能获得型突变。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
显性负性突变：部分错义突变可能通过干扰正常蛋白功能发挥显性负性效应，但具体机制需进一步研究。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0007165 (signal transduction) |
| • GO:0001736 (establishment of planar polarity) | • GO:0001843 (neural tube closure) |
| • GO:0016324 (apical plasma membrane) |
相关通路
• PCP pathway (Wnt signaling)
• Vangl signaling pathway
蛋白质功能简介
VANGL1蛋白是四次跨膜蛋白，定位于细胞膜，参与平面细胞极性（PCP）信号通路。该蛋白与Dvl等蛋白相互作用，调控细胞骨架重排和细胞迁移。在神经管发育中，VANGL1对于神经板弯曲和闭合至关重要。在癌症中，VANGL1可能通过促进上皮-间质转化（EMT）增强肿瘤细胞的侵袭能力。
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