VANGL2基因|基因功能、疾病关联、突变与细胞模型研究
VANGL2是平面细胞极性通路的核心基因,参与神经管闭合和器官发育,其突变与神经管缺陷和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | VANGL2 |
|---|---|
| 基因全名 | VANGL planar cell polarity protein 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q23.2 |
| NCBI Gene ID | 57216 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57216 |
| Ensembl ID | ENSG00000144230 |
| UniProt ID | Q9ULK5 |
| OMIM ID | 600533 |
| HGNC ID | 15514 |
| 基因别名 | STB1, LPP1, VANGL2 |
基因功能与研究简介
VANGL2基因编码Vang样蛋白2,是平面细胞极性(PCP)信号通路的核心组分。该蛋白是一种四次跨膜蛋白,参与调控细胞极性、迁移和形态发生。VANGL2在神经管闭合、内耳毛细胞定向和心脏发育中发挥关键作用。其突变可导致神经管缺陷(如脊柱裂)和先天性心脏病。此外,VANGL2在多种癌症中异常表达,与肿瘤侵袭和转移相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经管缺陷 | VANGL2突变导致PCP信号通路异常,影响神经管闭合,引起脊柱裂等。 | 已明确致病 |
| 先天性心脏病 | VANGL2突变影响心脏发育中的细胞极性,导致圆锥动脉干畸形等。 | 较强研究证据 |
| 癌症 | VANGL2在多种肿瘤中高表达,促进肿瘤细胞迁移和侵袭,与不良预后相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1465C>T (p.Arg489Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与神经管缺陷相关 |
| c.925G>A (p.Gly309Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白定位,与神经管缺陷相关 |
| c.1124T>C (p.Leu375Pro) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性,与神经管缺陷相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变导致VANGL2蛋白功能丧失或减弱,影响PCP信号通路,导致神经管闭合障碍。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明VANGL2存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变可能干扰正常VANGL2蛋白功能,但具体证据尚不充分。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0007165 (signal transduction) |
| • GO:0001736 (establishment of planar polarity) | • GO:0001843 (neural tube closure) |
| • GO:0040011 (locomotion) |
相关通路
• Planar cell polarity pathway (PCP)
• Wnt signaling pathway (non-canonical)
蛋白质功能简介
VANGL2蛋白由521个氨基酸组成,包含四个跨膜结构域,属于Vang样蛋白家族。该蛋白定位于细胞膜,参与PCP信号通路,调控细胞骨架重排和细胞迁移。VANGL2与Celsr1、Frizzled等蛋白相互作用,在发育过程中协调细胞极性。其功能异常与神经管缺陷和肿瘤进展密切相关。