VARS1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

VARS1编码缬氨酰-tRNA合成酶,是蛋白质合成中的关键酶,其突变可导致神经系统发育障碍等疾病。

基因信息卡

基因符号 VARS1
基因全名 valyl-tRNA synthetase 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 6p21.33
NCBI Gene ID 7407 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7407
Ensembl ID ENSG00000096171
UniProt ID P26640
OMIM ID 192150
HGNC ID 12651
基因别名 VARS; VARS2; G7A; VARS1

基因功能与研究简介

VARS1基因编码缬氨酰-tRNA合成酶,该酶催化缬氨酸与对应tRNA的结合,是蛋白质合成中的关键步骤。VARS1在多种组织中表达,尤其在神经系统中高表达。VARS1突变可导致多种疾病,包括神经发育障碍、脑病等。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍伴癫痫和脑病 VARS1突变导致酶活性降低或丧失,影响蛋白质合成,进而影响神经元功能。 ClinVar, OMIM
小头畸形 VARS1突变可能影响大脑发育,导致小头畸形。 ClinVar
痉挛性截瘫 部分VARS1突变与痉挛性截瘫相关。 ClinVar

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1001A>G (p.Asp334Gly) 错义突变 罕见 可能影响酶活性
c.1234C>T (p.Arg412Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白质稳定性
c.1567G>A (p.Glu523Lys) 错义突变 罕见 可能影响底物结合
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

多数VARS1突变导致酶活性降低或丧失,属于功能缺失型突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明VARS1突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分突变可能具有显性负效应,干扰正常等位基因的功能。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004812 (aminoacyl-tRNA ligase activity) • GO:0005524 (ATP binding)
• GO:0006430 (valyl-tRNA aminoacylation) • GO:0005737 (cytoplasm)

相关通路

hsa00970 (Aminoacyl-tRNA biosynthesis)
R-HSA-379724 (tRNA Aminoacylation)

蛋白质功能简介

VARS1蛋白是缬氨酰-tRNA合成酶,属于氨酰-tRNA合成酶家族。该酶在细胞质中催化缬氨酸与tRNAVal的结合,确保蛋白质合成中缬氨酸的正确掺入。VARS1在多种组织中表达,尤其在神经系统中高表达,提示其在神经元功能中的重要性。

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