VASN基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
VASN(vasorin)是一种跨膜蛋白,参与TGF-β信号通路调控,与动脉粥样硬化和肿瘤发生相关。
基因信息卡
| 基因符号 | VASN |
|---|---|
| 基因全名 | vasorin |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 16p13.3 |
| NCBI Gene ID | 114990 ncbi.nlm.nih.gov/gene/114990 |
| Ensembl ID | ENSG00000168140 |
| UniProt ID | Q6EMK4 |
| OMIM ID | 606603 |
| HGNC ID | 18517 |
| 基因别名 | SLITL2, MGC10731 |
基因功能与研究简介
VASN(vasorin)基因编码一种I型跨膜蛋白,属于SLIT家族相关蛋白。该蛋白在血管平滑肌细胞中高表达,参与调控TGF-β信号通路,影响细胞增殖、迁移和凋亡。VASN在动脉粥样硬化、肿瘤发生及纤维化等疾病中发挥重要作用。研究表明,VASN可能作为TGF-β的共受体或调节因子,通过调节SMAD信号传导影响细胞功能。此外,VASN在多种肿瘤中表达异常,与肿瘤进展和预后相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 动脉粥样硬化 | VASN在血管平滑肌细胞中高表达,可能通过调节TGF-β信号通路影响动脉粥样硬化的发生和发展。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | VASN在肝细胞癌中表达上调,与肿瘤侵袭和不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 肾细胞癌 | VASN在肾细胞癌中表达异常,可能参与肿瘤进展。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | VASN在结直肠癌中表达上调,与肿瘤分期和转移相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 主动脉 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HUVEC | 暂无可靠数据 | 人脐静脉内皮细胞 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能未知 |
| c.567del (p.Gly190ValfsTer23) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
移码突变可能导致蛋白截短,功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0007179 (transforming growth factor beta receptor signaling pathway) |
相关通路
• TGF-beta signaling pathway (hsa04350)
蛋白质功能简介
VASN蛋白是一种I型跨膜蛋白,包含信号肽、胞外区、跨膜区和胞内区。胞外区含有多个富含亮氨酸的重复序列(LRR),可能参与蛋白-蛋白相互作用。VASN在血管平滑肌细胞中高表达,通过调节TGF-β信号通路影响细胞功能。研究表明,VASN可能通过与TGF-β受体结合,调节SMAD2/3磷酸化,从而影响下游基因表达。此外,VASN还参与细胞外基质的重塑和细胞迁移。