VCPIP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
VCPIP1编码去泛素化酶,参与蛋白质质量控制、DNA损伤修复和细胞周期调控,与神经发育和肿瘤发生相关。
基因信息卡
| 基因符号 | VCPIP1 |
|---|---|
| 基因全名 | valosin containing protein interacting protein 1 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 8q13.1 |
| NCBI Gene ID | 80124 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80124 |
| Ensembl ID | ENSG00000104884 |
| UniProt ID | Q96JH7 |
| OMIM ID | 611253 |
| HGNC ID | 20251 |
| 基因别名 | DUBA3, VCIP135, VCPIP, deubiquitinating enzyme 3 |
基因功能与研究简介
VCPIP1(valosin containing protein interacting protein 1)基因编码一种去泛素化酶,属于肽酶C19家族。该蛋白与VCP/p97相互作用,参与泛素依赖性蛋白质降解、DNA损伤修复、细胞周期调控和膜融合等过程。VCPIP1在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,VCPIP1功能异常与神经发育障碍和肿瘤发生相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | VCPIP1突变可能导致蛋白质质量控制异常,影响神经元发育和功能,但具体机制尚在研究中。 | 暂无明确证据,但已有病例报道(PMID: 31585110) |
| 肿瘤 | VCPIP1在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控p53等抑癌蛋白的稳定性影响肿瘤发生发展。 | 研究证据较强(PMID: 28622513) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| U2OS | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.567del (p.Leu189fs) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能影响去泛素化酶活性。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004843 - thiol-dependent deubiquitinase | • GO:0006511 - ubiquitin-dependent protein catabolic process |
| • GO:0006281 - DNA repair | • GO:0007049 - cell cycle |
| • GO:0005634 - nucleus | • GO:0005829 - cytosol |
相关通路
• p97-mediated protein degradation (Reactome: R-HSA-1236974)
• DNA damage response (KEGG: hsa03430)
蛋白质功能简介
VCPIP1蛋白是一种去泛素化酶,含有肽酶C19结构域,能够去除底物蛋白上的泛素链。它通过与VCP/p97相互作用,参与内质网相关降解(ERAD)、DNA损伤修复和细胞周期调控。VCPIP1在维持基因组稳定性和蛋白质稳态中发挥重要作用。