VCPIP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

VCPIP1编码去泛素化酶,参与蛋白质质量控制、DNA损伤修复和细胞周期调控,与神经发育和肿瘤发生相关。

基因信息卡

基因符号 VCPIP1
基因全名 valosin containing protein interacting protein 1
基因类型 protein coding
染色体位置 8q13.1
NCBI Gene ID 80124 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80124
Ensembl ID ENSG00000104884
UniProt ID Q96JH7
OMIM ID 611253
HGNC ID 20251
基因别名 DUBA3, VCIP135, VCPIP, deubiquitinating enzyme 3

基因功能与研究简介

VCPIP1(valosin containing protein interacting protein 1)基因编码一种去泛素化酶,属于肽酶C19家族。该蛋白与VCP/p97相互作用,参与泛素依赖性蛋白质降解、DNA损伤修复、细胞周期调控和膜融合等过程。VCPIP1在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,VCPIP1功能异常与神经发育障碍和肿瘤发生相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 VCPIP1突变可能导致蛋白质质量控制异常,影响神经元发育和功能,但具体机制尚在研究中。 暂无明确证据,但已有病例报道(PMID: 31585110)
肿瘤 VCPIP1在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控p53等抑癌蛋白的稳定性影响肿瘤发生发展。 研究证据较强(PMID: 28622513)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
其他组织 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
U2OS 暂无可靠数据 常用细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.567del (p.Leu189fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能影响去泛素化酶活性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004843 - thiol-dependent deubiquitinase • GO:0006511 - ubiquitin-dependent protein catabolic process
• GO:0006281 - DNA repair • GO:0007049 - cell cycle
• GO:0005634 - nucleus • GO:0005829 - cytosol

相关通路

p97-mediated protein degradation (Reactome: R-HSA-1236974)
DNA damage response (KEGG: hsa03430)

蛋白质功能简介

VCPIP1蛋白是一种去泛素化酶,含有肽酶C19结构域,能够去除底物蛋白上的泛素链。它通过与VCP/p97相互作用,参与内质网相关降解(ERAD)、DNA损伤修复和细胞周期调控。VCPIP1在维持基因组稳定性和蛋白质稳态中发挥重要作用。

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