VGLL4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
VGLL4作为转录辅因子,通过调控Hippo信号通路参与器官大小控制和肿瘤抑制,是癌症研究的重要靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | VGLL4 |
|---|---|
| 基因全名 | Vestigial Like Family Member 4 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3p25.3 |
| NCBI Gene ID | 22839 ncbi.nlm.nih.gov/gene/22839 |
| Ensembl ID | ENSG00000144554 |
| UniProt ID | Q14135 |
| OMIM ID | 608902 |
| HGNC ID | 28966 |
| 基因别名 | VGL4, FLJ11259, MGC126851 |
基因功能与研究简介
VGLL4(Vestigial Like Family Member 4)是Vestigial样家族成员之一,编码一种转录辅因子,通过与TEAD家族转录因子相互作用调控基因表达。VGLL4在Hippo信号通路中发挥关键作用,通过竞争性结合TEADs抑制YAP/TAZ的转录活性,从而抑制细胞增殖和器官过度生长。VGLL4在多种癌症中表达下调,被认为是一种肿瘤抑制因子。此外,VGLL4还参与肌肉发育、心脏形态发生等过程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症(多种类型) | VGLL4通过抑制YAP/TAZ活性发挥肿瘤抑制作用,其表达下调或功能缺失可导致Hippo通路失调,促进肿瘤发生发展。 | 较强研究证据 |
| 胃癌 | VGLL4在胃癌中表达下调,与肿瘤分期和预后相关,可能通过调控YAP/β-catenin信号影响胃癌进展。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | VGLL4表达降低与结直肠癌的恶性程度和不良预后相关,可能通过抑制Wnt/β-catenin通路发挥作用。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | VGLL4在非小细胞肺癌中表达下调,其低表达与患者生存率降低相关,可能通过调控Hippo通路影响肿瘤生长。 | 较强研究证据 |
| 肝癌 | VGLL4在肝细胞癌中表达下调,可能通过抑制YAP活性抑制肿瘤增殖和转移。 | 潜在关联 |
| 乳腺癌 | VGLL4表达异常与乳腺癌的发生发展相关,可能通过调控TEADs影响肿瘤细胞增殖。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.421C>T (p.Arg141Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.574_575del (p.Leu192ValfsTer3) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1000G>A (p.Gly334Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致VGLL4蛋白功能丧失或减弱,可能解除对YAP/TAZ的抑制,促进细胞增殖和肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明VGLL4存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前暂无明确证据表明VGLL4存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003712 (transcription coregulator activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0006351 (transcription |
| • DNA-templated) | • GO:0006355 (regulation of transcription |
| • DNA-templated) | • GO:0008285 (negative regulation of cell population proliferation) |
| • GO:0035329 (hippo signaling) |
相关通路
• Hippo signaling pathway (KEGG: hsa04390)
• Transcriptional regulation by VGLL4 (Reactome: R-HSA-8939243)
蛋白质功能简介
VGLL4蛋白包含一个TONDU(TDU)结构域,该结构域介导与TEAD转录因子的相互作用。VGLL4通过竞争性结合TEADs,抑制YAP/TAZ-TEAD复合物的形成,从而抑制下游靶基因的转录。VGLL4在多种组织中表达,尤其在心脏和骨骼肌中丰富。其表达水平受转录和翻译后修饰调控,如泛素化降解。VGLL4的失调与多种癌症相关,是潜在的肿瘤抑制因子。