VMA21基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
VMA21基因编码液泡ATP酶组装因子,其突变可导致X连锁肌病伴过度自噬,是研究自噬与肌肉疾病的关键基因。
基因信息卡
| 基因符号 | VMA21 |
|---|---|
| 基因全名 | Vacuolar ATPase assembly factor VMA21 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | Xq28 |
| NCBI Gene ID | 203547 ncbi.nlm.nih.gov/gene/203547 |
| Ensembl ID | ENSG00000160131 |
| UniProt ID | Q3KNS6 |
| OMIM ID | 300447 |
| HGNC ID | 22082 |
| 基因别名 | HCCS1; MGC29643 |
基因功能与研究简介
VMA21基因编码液泡ATP酶(V-ATPase)组装因子,该蛋白在酵母和哺乳动物中高度保守,参与V-ATPase V0结构域的组装和功能调控。V-ATPase在细胞内膜系统中负责质子泵送,维持细胞器酸化,对蛋白质降解、受体介导的内吞和自噬等过程至关重要。VMA21基因突变可导致X连锁肌病伴过度自噬(XMEA),该疾病以肌纤维中自噬体积累为特征。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| X连锁肌病伴过度自噬 | VMA21基因突变导致V-ATPase组装异常,影响溶酶体酸化,导致自噬体清除障碍,在肌纤维中积累,引起肌病。 | 已明确致病 |
| 癌症相关 | 暂无明确证据 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| C2C12 | 暂无可靠数据 | 肌细胞分化中表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.164-1G>C | 剪接位点突变 | 罕见 | 导致外显子跳跃,产生截短蛋白,功能丧失 |
| c.346C>T (p.Arg116Ter) | 无义突变 | 罕见 | 产生截短蛋白,功能丧失 |
| c.97C>T (p.Arg33Ter) | 无义突变 | 罕见 | 产生截短蛋白,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
VMA21基因突变导致蛋白功能丧失,影响V-ATPase组装,导致溶酶体酸化障碍。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0005764 lysosome |
| • GO:0033177 proton-transporting two-sector ATPase complex | • proton-transporting domain |
| • GO:0046961 proton-transporting ATPase activity | • rotational mechanism |
| • GO:0007034 vacuolar transport |
相关通路
• hsa04142 Lysosome
• hsa04140 Autophagy - animal
蛋白质功能简介
VMA21蛋白是V-ATP酶组装因子,位于内质网,参与V0结构域的组装和转运。该蛋白包含一个跨膜结构域和一个保守的VMA21结构域,通过与V0亚基相互作用促进V-ATPase复合物的正确组装。VMA21功能缺失导致V-ATPase活性降低,影响溶酶体酸化,进而导致自噬体清除障碍。