VPS33B基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

VPS33B是HOPS复合物核心亚基,参与囊泡运输与膜融合,其突变导致关节挛缩-肾功能不全-胆汁淤积综合征(ARC综合征)。

基因信息卡

基因符号 VPS33B
基因全名 VPS33B, CORVET/HOPS complex subunit
基因类型 protein-coding
染色体位置 15q26.1
NCBI Gene ID 26273 ncbi.nlm.nih.gov/gene/26273
Ensembl ID ENSG00000184056
UniProt ID Q9H267
OMIM ID 608552
HGNC ID 12712
基因别名 ARC1, FLJ11151, MGC15887

基因功能与研究简介

VPS33B基因编码一种参与囊泡运输的蛋白质,是HOPS(homotypic fusion and protein sorting)复合物的核心亚基之一。该复合物在细胞内吞和溶酶体融合过程中发挥关键作用。VPS33B蛋白通过与VPS16B等蛋白相互作用,调节膜融合事件,对多种组织的正常功能至关重要。VPS33B基因突变可导致常染色体隐性遗传病ARC综合征(关节挛缩-肾功能不全-胆汁淤积综合征),表现为关节屈曲挛缩、肾小管功能障碍和胆汁淤积。此外,VPS33B在血小板α颗粒生物发生中也具有重要作用,其缺陷可导致血小板功能异常。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
关节挛缩-肾功能不全-胆汁淤积综合征(ARC综合征) VPS33B基因突变导致HOPS复合物功能异常,影响囊泡运输和膜融合,进而导致多器官发育和功能障碍。 已明确致病
血小板α颗粒缺乏症 VPS33B缺陷影响血小板α颗粒的形成和释放,导致出血倾向。 具有较强研究证据
癌症相关 暂无明确证据表明VPS33B直接参与癌症发生,但部分研究提示其表达异常可能与肿瘤进展相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肾脏 暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 高表达
胎盘 暂无可靠数据 高表达
骨骼肌 暂无可靠数据 中等表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.139G>A (p.Gly47Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白折叠或稳定性
c.325C>T (p.Arg109Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
c.1184+1G>A 剪接突变 罕见 影响mRNA剪接,导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

大多数VPS33B突变导致功能丧失,包括无义突变、移码突变和剪接突变,导致蛋白截短或降解,破坏HOPS复合物功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明VPS33B存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明VPS33B突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0006886 intracellular protein transport
• GO:0006906 vesicle fusion • GO:0016192 vesicle-mediated transport
• GO:0030897 HOPS complex • GO:0043231 intracellular membrane-bounded organelle

相关通路

Endocytosis
Lysosome biogenesis
Autophagy

蛋白质功能简介

VPS33B蛋白由617个氨基酸组成,属于Sec1/Munc18家族,是HOPS复合物的核心亚基。该复合物在酵母和哺乳动物中高度保守,介导囊泡与靶膜的融合。VPS33B通过与VPS16B、VPS18等蛋白相互作用,参与晚期内体/溶酶体融合过程。在血小板中,VPS33B与VPS16B形成复合物,调控α颗粒的成熟和分泌。VPS33B蛋白的亚细胞定位主要在内体/溶酶体膜上。

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