VPS35基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
VPS35是逆转录复合体的核心组分,参与内体-高尔基体蛋白分选,其突变与帕金森病等神经退行性疾病密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | VPS35 |
|---|---|
| 基因全名 | VPS35 retromer complex component |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 16q11.2 |
| NCBI Gene ID | 55737 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55737 |
| Ensembl ID | ENSG00000083312 |
| UniProt ID | Q96QK1 |
| OMIM ID | 601501 |
| HGNC ID | 13487 |
| 基因别名 | FLJ11856, MEM3, PARK17 |
基因功能与研究简介
VPS35基因编码逆转录复合体的核心组分,该复合体介导内体到高尔基体的蛋白分选,参与多种跨膜蛋白的回收。VPS35突变与常染色体显性帕金森病相关,其功能异常影响神经元的存活和突触功能。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 帕金森病 | VPS35突变(如D620N)导致逆转录复合体功能异常,影响Wnt信号通路和自噬,导致多巴胺能神经元变性。 | 已明确致病 |
| 阿尔茨海默病 | VPS35表达水平变化可能影响APP加工和Aβ产生,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
| 癌症 | VPS35在多种肿瘤中表达异常,可能影响细胞增殖和迁移,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾上腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| D620N | 错义突变 | 罕见 | 功能获得性突变,导致逆转录复合体功能异常,与帕金森病相关 |
| P316S | 错义突变 | 罕见 | 功能影响尚不明确,可能影响蛋白稳定性 |
| R524W | 错义突变 | 罕见 | 功能影响尚不明确,可能影响蛋白相互作用 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
VPS35功能缺失突变可能导致逆转录复合体功能障碍,影响蛋白分选,但具体致病机制尚不明确。
Gain of Function(功能获得,GOF)
D620N突变被认为是一种功能获得性突变,增强与WASH复合体的相互作用,导致Wnt信号通路异常。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明VPS35突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006886 (intracellular protein transport) | • GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport |
| • Golgi to ER) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005829 (cytosol) | • GO:0030904 (retromer complex) |
相关通路
• Retromer-mediated transport (Reactome: R-HSA-432722)
• Endosomal recycling (Reactome: R-HSA-432720)
蛋白质功能简介
VPS35蛋白是逆转录复合体的核心组分,与VPS26和VPS29形成三聚体,介导内体到高尔基体的蛋白分选。VPS35参与多种跨膜蛋白的回收,如Wnt受体、AMPA受体等,对神经元功能至关重要。
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