VPS36基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
VPS36是ESCRT-II复合物的核心亚基，参与内体分选、自噬和DNA损伤修复，其功能异常与神经发育障碍和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | VPS36 |
|---|---|
| 基因全名 | vacuolar protein sorting 36 homolog |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 13q14.3 |
| NCBI Gene ID | 51028 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51028 |
| Ensembl ID | ENSG00000102547 |
| UniProt ID | Q86VN1 |
| OMIM ID | 610903 |
| HGNC ID | 24983 |
| 基因别名 | C13orf9, CGI-145, ESCRT-II complex subunit VPS36 |
基因功能与研究简介
VPS36基因编码ESCRT-II复合物的一个亚基，该复合物在内体膜上参与多泡体（MVB）的形成和蛋白质分选。VPS36通过其GLUE结构域结合泛素化货物和磷脂酰肌醇3-磷酸（PI3P），在ESCRT途径中发挥关键作用。此外，VPS36还参与自噬、细胞分裂和DNA损伤修复等过程。VPS36功能异常与神经发育障碍和癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | VPS36突变可能导致ESCRT功能受损，影响神经元发育和突触功能，但具体机制尚在研究中。 | 暂无明确证据 |
| 癌症 | VPS36在多种肿瘤中表达异常，可能通过影响ESCRT途径和DNA修复促进肿瘤发生发展。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾上腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.Ile41Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或功能，但具体影响未知 |
| c.456C>T (p.Arg152Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白，可能引起功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
功能丧失型突变，如无义突变或移码突变，导致VPS36蛋白功能缺失，影响ESCRT-II复合物功能。
Gain of Function（功能获得，GOF）
暂无明确证据表明VPS36存在功能获得型突变。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
暂无明确证据表明VPS36存在显性负性突变。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005768 endosome |
| • GO:0005770 late endosome | • GO:0007034 vacuolar transport |
| • GO:0015031 protein transport | • GO:0035091 phosphatidylinositol binding |
| • GO:0043130 ubiquitin binding | • GO:0071985 ESCRT II complex |
相关通路
• ESCRT pathway (Reactome: R-HSA-917729)
• Endosomal Sorting Complex Required for Transport (ESCRT) (KEGG: hsa04144)
蛋白质功能简介
VPS36蛋白是ESCRT-II复合物的一个亚基，该复合物由VPS22、VPS25和VPS36组成。VPS36包含一个N端GLUE结构域，能够结合泛素和磷脂酰肌醇3-磷酸，从而将ESCRT-II招募到内体膜上。ESCRT-II在MVB形成中起关键作用，并参与自噬、细胞分裂和DNA损伤修复。VPS36的异常表达或突变与多种疾病相关，包括神经发育障碍和癌症。
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