VPS37A基因|基因功能、疾病关联、突变与ESCRT复合体研究
VPS37A是ESCRT-I复合体的核心亚基,参与囊泡运输、病毒出芽及肿瘤抑制,其突变与遗传性痉挛性截瘫相关。
基因信息卡
| 基因符号 | VPS37A |
|---|---|
| 基因全名 | VPS37A subunit of ESCRT-I |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 8p22 |
| NCBI Gene ID | 137492 ncbi.nlm.nih.gov/gene/137492 |
| Ensembl ID | ENSG00000155975 |
| UniProt ID | Q8N1P3 |
| OMIM ID | 609927 |
| HGNC ID | 24931 |
| 基因别名 | HCRP1, MGC112998 |
基因功能与研究简介
VPS37A(Vacuolar Protein Sorting 37A)是ESCRT-I(Endosomal Sorting Complex Required for Transport I)复合体的一个亚基,该复合体在细胞内膜系统(如内体)中负责泛素化膜蛋白的分选和降解,参与多泡体(MVB)的形成。VPS37A还参与病毒出芽、细胞分裂和自噬等过程。研究表明,VPS37A在多种肿瘤中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子。此外,VPS37A基因突变与遗传性痉挛性截瘫(HSP)相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 遗传性痉挛性截瘫 | VPS37A基因突变导致ESCRT-I功能受损,影响神经元内体运输,导致轴突变性。 | 已明确致病 |
| 肝细胞癌 | VPS37A表达下调与肝细胞癌的进展和不良预后相关。 | 具有较强研究证据 |
| 乳腺癌 | VPS37A表达降低与乳腺癌的侵袭性和转移相关。 | 具有较强研究证据 |
| 肺癌 | VPS37A在非小细胞肺癌中表达下调,可能参与肿瘤抑制。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.493C>T (p.Arg165Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1045C>T (p.Arg349Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1129C>T (p.Arg377Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致VPS37A蛋白截短或降解,破坏ESCRT-I复合体功能,影响内体运输。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005768 (endosome) | • GO:0000814 (ESCRT I complex) |
| • GO:0007034 (vacuolar transport) | • GO:0015031 (protein transport) |
| • GO:0043162 (ubiquitin-dependent protein catabolic process) |
相关通路
• ESCRT pathway (Reactome: R-HSA-917729)
• Endosomal Sorting Complex Required for Transport (ESCRT) (KEGG: hsa04144)
蛋白质功能简介
VPS37A蛋白是ESCRT-I复合体的组成部分,该复合体由VPS23、VPS28、VPS37和VPS36亚基组成。VPS37A通过其C端结构域与VPS28相互作用,参与将泛素化货物蛋白分选进入多泡体。VPS37A还参与病毒出芽,如HIV-1的释放。在细胞中,VPS37A的缺失会导致内体运输障碍,影响细胞信号传导和稳态。