VPS37C基因|功能、疾病关联、突变与表达图谱

VPS37C是ESCRT-I复合物的核心亚基,参与内体分选、自噬及病毒出芽,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 VPS37C
基因全名 VPS37C subunit of ESCRT-I
基因类型 protein-coding
染色体位置 11q12.3
NCBI Gene ID 55048 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55048
Ensembl ID ENSG00000167972
UniProt ID A5D8V7
OMIM ID 615221
HGNC ID 26097
基因别名 FLJ12770, HSPC294, MGC102782

基因功能与研究简介

VPS37C(VPS37C subunit of ESCRT-I)是内体分选复合物ESCRT-I的亚基之一,与VPS28、VPS37A/B/D及TSG101共同组成ESCRT-I复合物。该复合物在泛素化膜蛋白的分选、多泡体形成、自噬、病毒出芽及细胞分裂等过程中发挥关键作用。VPS37C通过其C端结构域与VPS28相互作用,参与货物识别和膜弯曲。研究表明,VPS37C在神经发育中具有重要功能,其突变与常染色体隐性遗传的神经发育障碍相关。此外,VPS37C在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 VPS37C纯合或复合杂合突变导致功能丧失,影响ESCRT-I复合物功能,干扰神经元内体运输和自噬,导致神经发育异常。 OMIM, ClinVar
癌症 VPS37C在多种肿瘤中表达下调或突变,可能影响ESCRT-I介导的受体降解,促进肿瘤进展。 COSMIC, 文献

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达(GTEx)
睾丸 暂无可靠数据 高表达(GTEx)
暂无可靠数据 中等表达(GTEx)
暂无可靠数据 低表达(GTEx)
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.493C>T (p.Arg165Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1042C>T (p.Arg348Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1186G>A (p.Gly396Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致VPS37C蛋白截短或降解,破坏ESCRT-I复合物功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005768 (endosome) • GO:0000814 (ESCRT I complex)
• GO:0007034 (vacuolar transport) • GO:0015031 (protein transport)
• GO:0006914 (autophagy)

相关通路

ESCRT pathway (Reactome: R-HSA-917729)
Autophagy (KEGG: hsa04140)

蛋白质功能简介

VPS37C蛋白由约400个氨基酸组成,包含一个N端的coiled-coil结构域和一个C端的VPS28结合结构域。作为ESCRT-I复合物的亚基,VPS37C参与识别泛素化货物并促进内体膜出芽。VPS37C在脑组织中高表达,提示其在神经元中的重要作用。

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