VPS45基因|功能、疾病关联、突变与表达图谱
VPS45编码高尔基体运输相关蛋白,其突变可导致免疫缺陷和中性粒细胞减少症。
基因信息卡
| 基因符号 | VPS45 |
|---|---|
| 基因全名 | VPS45 core subunit of CORVET and HOPS complexes |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q21.2 |
| NCBI Gene ID | 11311 ncbi.nlm.nih.gov/gene/11311 |
| Ensembl ID | ENSG00000143119 |
| UniProt ID | Q9H1J7 |
| OMIM ID | 610035 |
| HGNC ID | 14579 |
| 基因别名 | VPS45A, VSP45, hVPS45 |
基因功能与研究简介
VPS45基因编码VPS45蛋白,是CORVET和HOPS复合物的核心亚基,参与细胞内囊泡运输和膜融合过程。该蛋白在维持高尔基体结构和功能中发挥重要作用。VPS45基因突变可导致常染色体隐性遗传的免疫缺陷病,表现为中性粒细胞减少、血小板减少和反复感染。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 免疫缺陷伴中性粒细胞减少 | VPS45基因突变导致蛋白功能丧失,影响溶酶体相关细胞器运输,进而损害中性粒细胞功能,导致免疫缺陷。 | 已明确致病 |
| 骨髓纤维化 | 部分VPS45突变患者出现骨髓纤维化,可能与造血干细胞功能异常有关。 | 具有较强研究证据 |
| 血小板减少 | VPS45突变可导致血小板减少,机制可能与巨核细胞成熟障碍有关。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| Jurkat | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.433C>T (p.Arg145Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1040T>C (p.Leu347Pro) | 错义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1151G>A (p.Arg384Gln) | 错义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
VPS45基因突变导致蛋白功能丧失,影响囊泡运输,导致疾病。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005484 (SNAP receptor activity) | • GO:0006886 (intracellular protein transport) |
| • GO:0016192 (vesicle-mediated transport) | • GO:0005768 (endosome) |
| • GO:0005794 (Golgi apparatus) |
相关通路
• Endocytosis
• Autophagy
• Membrane Trafficking
蛋白质功能简介
VPS45蛋白是CORVET和HOPS复合物的核心亚基,参与早期内体融合和溶酶体生物发生。该蛋白含有Sec1/Munc18-like结构域,与SNARE蛋白相互作用,调控膜融合过程。VPS45在造血细胞中高表达,对中性粒细胞和血小板的正常功能至关重要。