VPS51基因|功能、疾病关联、突变与细胞模型研究

VPS51是内体-高尔基体转运关键蛋白,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 VPS51
基因全名 VPS51 subunit of GARP complex
基因类型 protein-coding
染色体位置 11q13.1
NCBI Gene ID 79735 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79735
Ensembl ID ENSG00000137710
UniProt ID Q9H8H2
OMIM ID 615545
HGNC ID 29122
基因别名 C11orf2, PPP1R150, VPS51P

基因功能与研究简介

VPS51基因编码GARP复合体的一个亚基,该复合体参与内体到高尔基体的囊泡转运。VPS51蛋白与VPS52、VPS53和VPS54共同组成GARP复合体,在维持细胞内膜系统稳态中发挥重要作用。研究表明,VPS51功能缺失可导致神经发育障碍,表现为智力障碍、小头畸形和胼胝体发育不全等。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 VPS51基因突变导致GARP复合体功能受损,影响内体-高尔基体转运,进而影响神经元发育和功能。 已明确致病
小头畸形 VPS51突变与常染色体隐性遗传小头畸形相关,可能通过影响神经祖细胞增殖和分化。 已明确致病
胼胝体发育不全 部分VPS51突变患者表现为胼胝体发育不全,提示其在轴突导向和胼胝体形成中的作用。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 内源性表达
HEK293 暂无可靠数据 内源性表达
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经细胞系表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.567_568del (p.Leu190fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.890A>G (p.Tyr297Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):无义突变或移码突变导致截短蛋白或mRNA降解,使GARP复合体功能丧失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明VPS51存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性效应):目前暂无明确证据表明VPS51突变具有显性负性效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006886 (intracellular protein transport) • GO:0006897 (endocytosis)
• GO:0007032 (endosome organization) • GO:0034058 (endosomal vesicle fusion)
• GO:0005794 (Golgi apparatus) • GO:0005829 (cytosol)

相关通路

Endosomal transport pathway (Reactome: R-HSA-432720)
Golgi-to-ER retrograde transport (Reactome: R-HSA-6811434)

蛋白质功能简介

VPS51蛋白是GARP复合体的亚基,该复合体定位于反式高尔基体网络,介导内体来源的囊泡与高尔基体的融合。VPS51包含一个N端结构域,可能参与蛋白相互作用。其功能缺失导致内体-高尔基体转运障碍,影响细胞极性、神经元迁移和突触形成。

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