VPS8基因|功能、疾病关联、突变与表达图谱
VPS8是CORVET复合体的核心亚基,参与内体-溶酶体途径的膜融合,其突变与神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | VPS8 |
|---|---|
| 基因全名 | VPS8 subunit of CORVET complex |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3q13.31 |
| NCBI Gene ID | 23355 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23355 |
| Ensembl ID | ENSG00000114416 |
| UniProt ID | Q8N3P4 |
| OMIM ID | 615860 |
| HGNC ID | 29158 |
| 基因别名 | KIAA0804 |
基因功能与研究简介
VPS8(VPS8 subunit of CORVET complex)是CORVET复合体的一个亚基,该复合体在内体-溶酶体途径中介导膜融合。VPS8与VPS3、VPS11、VPS16、VPS18和VPS33A等蛋白相互作用,形成CORVET复合体,在早期内体融合中发挥关键作用。VPS8的突变可能导致内体运输障碍,进而影响细胞功能,与神经发育障碍等疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | VPS8突变导致CORVET复合体功能异常,影响内体运输和神经发育,可能引起智力障碍和发育迟缓。 | ClinVar |
| 暂无明确证据 | 暂无可靠数据 | 暂无明确证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.2345delC (p.Pro782LeufsTer3) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失型突变):导致VPS8蛋白功能缺失或显著降低,影响CORVET复合体功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明VPS8存在此类突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明VPS8存在此类突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005768 (endosome) | • GO:0005769 (early endosome) |
| • GO:0016020 (membrane) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0006886 (intracellular protein transport) | • GO:0006897 (endocytosis) |
相关通路
• Endosomal/Vacuolar pathway (CORVET complex)
• Membrane trafficking
蛋白质功能简介
VPS8蛋白是CORVET复合体的亚基,该复合体在早期内体融合中起关键作用。VPS8蛋白包含一个RING finger结构域和一个VPS9结构域,可能参与蛋白-蛋白相互作用和膜融合过程。VPS8在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中表达较高。