VRTN基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

VRTN(vestigial-like family member 4)基因编码一种转录共激活因子,参与骨骼肌发育和脂肪沉积,与猪脊椎数变异及人类疾病相关。

基因信息卡

基因符号 VRTN
基因全名 vestigial-like family member 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 14q24.3
NCBI Gene ID 55237 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55237
Ensembl ID ENSG00000100823
UniProt ID Q9H0I3
OMIM ID 610001
HGNC ID 28879
基因别名 VRTN, C14orf32, FLJ10769, MGC126851

基因功能与研究简介

VRTN(vestigial-like family member 4)基因编码一种转录共激活因子,属于vestigial-like蛋白家族。该蛋白与TEA domain transcription factor(TEAD)相互作用,参与调控基因表达,影响骨骼肌发育、脂肪沉积和细胞增殖。在猪中,VRTN基因的突变与脊椎数增加相关,影响产肉量。在人类中,VRTN基因的变异可能与某些疾病相关,但具体机制尚在研究中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
暂无明确疾病关联 暂无明确证据 暂无可靠数据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨骼肌 暂无可靠数据 高表达
脂肪组织 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
C2C12(小鼠成肌细胞) 暂无可靠数据 用于研究肌肉分化
3T3-L1(小鼠脂肪前体细胞) 暂无可靠数据 用于研究脂肪生成
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.310A>G (p.Thr104Ala) SNV 未知 可能影响蛋白功能,但证据不足
c.105C>T (p.Pro35Leu) SNV 未知 可能影响蛋白功能,但证据不足
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致VRTN蛋白功能丧失或减弱,可能影响肌肉和脂肪发育。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:增强VRTN蛋白功能,可能促进细胞增殖,但具体效应需进一步研究。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白干扰正常VRTN蛋白的功能,可能影响转录调控。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003713 (transcription coactivator activity) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II)

相关通路

Hippo signaling pathway (WP454)
Transcriptional regulation by VRTN (暂无Pathway ID)

蛋白质功能简介

VRTN蛋白是一种转录共激活因子,含有Vestigial-like结构域,与TEAD转录因子结合,调控下游基因表达。在肌肉和脂肪组织中表达,参与细胞增殖和分化。在猪中,VRTN基因的插入突变导致脊椎数增加,影响产肉量。在人类中,VRTN蛋白可能参与发育和疾病过程,但具体功能仍需深入研究。

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