VSIG2基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
VSIG2(V-set and immunoglobulin domain containing 2)是一种免疫球蛋白超家族成员,在免疫调节和肿瘤发生中具有潜在作用。
基因信息卡
| 基因符号 | VSIG2 |
|---|---|
| 基因全名 | V-set and immunoglobulin domain containing 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | chr11:124,558,000-124,562,000 (GRCh38) |
| NCBI Gene ID | 23584 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23584 |
| Ensembl ID | ENSG00000137710 |
| UniProt ID | Q96IQ7 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:20219 |
| 基因别名 | CTH, CXADR-like membrane protein, 1110001A05Rik (mouse) |
基因功能与研究简介
VSIG2(V-set and immunoglobulin domain containing 2)是免疫球蛋白超家族成员,其编码蛋白包含一个V-set免疫球蛋白结构域,可能参与细胞黏附、免疫调节和肿瘤发生。VSIG2在多种组织中表达,尤其在免疫细胞和上皮细胞中。研究表明,VSIG2可能作为免疫检查点分子,在肿瘤微环境中发挥免疫抑制作用。此外,VSIG2的异常表达与多种癌症的预后相关,但其具体功能机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | VSIG2在结直肠癌中表达上调,可能通过抑制T细胞活性促进肿瘤免疫逃逸。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | VSIG2在肝细胞癌中高表达,与不良预后相关,可能参与肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 胃癌 | VSIG2在胃癌中表达异常,可能作为潜在预后标志物。 | 潜在关联 |
| 非小细胞肺癌 | VSIG2表达与免疫浸润相关,可能影响免疫治疗反应。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胃 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HCT116 (结直肠癌) | 暂无可靠数据 | VSIG2表达上调 |
| HepG2 (肝癌) | 暂无可靠数据 | VSIG2表达上调 |
| A549 (肺癌) | 暂无可靠数据 | VSIG2表达中等 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能未知 |
| c.456G>A (p.Trp152Ter) | 无义突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变可能导致蛋白功能丧失,影响免疫调节。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0007155 (cell adhesion) |
| • GO:0006955 (immune response) |
相关通路
• 暂无明确通路数据
蛋白质功能简介
VSIG2蛋白是一种I型跨膜蛋白,包含一个V-set免疫球蛋白结构域,可能参与细胞间相互作用和免疫调节。其胞外区可能介导与配体的结合,胞内区含有免疫受体酪氨酸抑制基序(ITIM)样序列,提示其可能传递抑制性信号。VSIG2在多种免疫细胞和肿瘤细胞中表达,可能通过抑制T细胞活化促进肿瘤免疫逃逸。