VWA5A基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
VWA5A(von Willebrand factor A domain-containing protein 5A)是一种含有vWF-A结构域的蛋白,参与细胞黏附、迁移和肿瘤抑制,与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | VWA5A |
|---|---|
| 基因全名 | von Willebrand factor A domain containing 5A |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11q24.2 |
| NCBI Gene ID | 4013 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4013 |
| Ensembl ID | ENSG00000110427 |
| UniProt ID | O00534 |
| OMIM ID | 606001 |
| HGNC ID | 12714 |
| 基因别名 | BC-4, C11orf4, DKFZp686K23112, FLJ12443, PP1067 |
基因功能与研究简介
VWA5A基因编码一种含有von Willebrand factor A(vWF-A)结构域的蛋白质,该蛋白在细胞外基质中发挥作用,参与细胞黏附、迁移和信号转导。研究表明,VWA5A在多种肿瘤中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子,通过调节细胞-基质相互作用影响肿瘤的侵袭和转移。此外,VWA5A还参与血管生成和炎症反应。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | VWA5A表达下调与乳腺癌的侵袭和转移相关,可能通过影响细胞黏附促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | 在非小细胞肺癌中,VWA5A表达降低与预后不良相关,可能参与肿瘤抑制。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | VWA5A在结直肠癌中表达下调,可能通过调节Wnt信号通路影响肿瘤发生。 | 潜在关联 |
| 肝细胞癌 | VWA5A表达降低与肝癌的侵袭性相关,可能作为预后标志物。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
| c.567_568insA (p.Gly190fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致移码,可能丧失功能 |
| c.890A>G (p.Glu297Gly) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变,如无义突变或移码突变,导致蛋白截短或降解,丧失正常功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明VWA5A存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明VWA5A存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005576 (extracellular region) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• hsa04510 (Focal adhesion)
• hsa04512 (ECM-receptor interaction)
蛋白质功能简介
VWA5A蛋白含有vWF-A结构域,该结构域参与蛋白质-蛋白质相互作用。VWA5A定位于细胞外基质和细胞膜,可能通过调节整合素信号通路影响细胞黏附。在多种肿瘤中表达下调,提示其可能作为肿瘤抑制因子。