WASHC2C基因|功能、疾病关联、突变与表达图谱
WASHC2C是WASH复合物的核心亚基,参与内体分选和肌动蛋白聚合,其突变与神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | WASHC2C |
|---|---|
| 基因全名 | WASH complex subunit 2C |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10q11.23 |
| NCBI Gene ID | 253725 ncbi.nlm.nih.gov/gene/253725 |
| Ensembl ID | ENSG00000119912 |
| UniProt ID | Q9Y4E1 |
| OMIM ID | 617507 |
| HGNC ID | 29213 |
| 基因别名 | FAM21C, KIAA0592 |
基因功能与研究简介
WASHC2C(WASH complex subunit 2C)是WASH复合物的一个亚基,该复合物是ARP2/3肌动蛋白聚合的激活剂,参与内体分选和囊泡运输。WASHC2C在细胞中通过与WASH复合物其他亚基相互作用,调控内体膜上的肌动蛋白聚合,从而影响内体分选和细胞迁移。研究表明,WASHC2C的突变与神经发育障碍相关,但其具体机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | WASHC2C突变可能导致WASH复合物功能异常,影响内体分选和神经元发育,但具体机制尚不明确。 | ClinVar收录有致病性变异,但证据有限。 |
| 癌症 | WASHC2C在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤侵袭和转移,但直接致病证据不足。 | COSMIC数据库记录有体细胞突变,但频率低。 |
| 暂无明确疾病关联 | 目前尚无其他明确疾病关联。 | 暂无可靠数据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但致病性未明确。 |
| c.567del (p.Leu189fs) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失。 |
| c.890C>T (p.Thr297Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性,但证据不足。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
移码突变和截短突变可能导致蛋白功能丧失,影响WASH复合物功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0005886 plasma membrane | • GO:0030136 clathrin-coated vesicle |
| • GO:0031902 late endosome membrane | • GO:0045334 clathrin-coated endocytic vesicle |
| • GO:0071208 WASH complex |
相关通路
• Endosomal transport
• Actin polymerization
蛋白质功能简介
WASHC2C蛋白是WASH复合物的亚基,该复合物作为ARP2/3肌动蛋白聚合的激活剂,参与内体分选和囊泡运输。WASHC2C蛋白包含多个蛋白相互作用结构域,可能参与调控内体膜上的肌动蛋白聚合。其功能异常可能导致内体分选障碍,影响细胞迁移和神经发育。