WDR19基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
WDR19编码IFT144,是纤毛内运输复合物A的关键组分,其突变导致多种纤毛病。
基因信息卡
| 基因符号 | WDR19 |
|---|---|
| 基因全名 | WD repeat domain 19 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 4p14 |
| NCBI Gene ID | 57728 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57728 |
| Ensembl ID | ENSG00000157796 |
| UniProt ID | Q8NEZ3 |
| OMIM ID | 608151 |
| HGNC ID | 18340 |
| 基因别名 | IFT144, NPHP13, SRTD5, CED4 |
基因功能与研究简介
WDR19基因编码WD重复结构域蛋白19,是纤毛内运输复合物A(IFT-A)的组成部分,参与纤毛的组装和功能维持。该基因突变可导致多种纤毛病,包括肾消耗病(nephronophthisis)、Senior-Løken综合征、短肋胸廓发育不良等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肾消耗病 | WDR19突变导致IFT-A功能异常,影响肾小管纤毛功能,引起肾囊肿和肾功能衰竭。 | 已明确致病 |
| Senior-Løken综合征 | WDR19突变导致视网膜和肾脏纤毛功能障碍,表现为视网膜色素变性和肾消耗病。 | 已明确致病 |
| 短肋胸廓发育不良 | WDR19突变影响骨骼发育中的纤毛信号通路,导致胸廓狭窄和四肢短小。 | 已明确致病 |
| Joubert综合征 | WDR19突变可能影响小脑和脑干发育,导致共济失调和呼吸异常。 | 较强研究证据 |
| 多囊卵巢综合征 | WDR19变异可能影响卵巢纤毛功能,与多囊卵巢综合征相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 肾上皮细胞 | 暂无可靠数据 | 纤毛相关 |
| 视网膜色素上皮细胞 | 暂无可靠数据 | 纤毛相关 |
| 成纤维细胞 | 暂无可靠数据 | 纤毛相关 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.3715C>T (p.Arg1239Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1672C>T (p.Arg558Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.4048C>T (p.Arg1350Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.3559C>T (p.Arg1187Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白截短,丧失IFT-A功能,影响纤毛组装。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005813 (centrosome) | • GO:0005814 (centriole) |
| • GO:0005856 (cytoskeleton) | • GO:0005929 (cilium) |
| • GO:0030992 (intraciliary transport particle A) | • GO:0035253 (ciliary neurotrophic factor receptor binding) |
| • GO:0042995 (cell projection) | • GO:0060271 (cilium assembly) |
相关通路
• Cilium Assembly (GO:0060271)
• Intraflagellar transport (GO:0035720)
• Hedgehog signaling pathway (GO:0007224)
蛋白质功能简介
WDR19蛋白(IFT144)是IFT-A复合物的核心组分,参与纤毛内逆向运输,对纤毛的组装和功能至关重要。该蛋白包含WD重复结构域,可能参与蛋白质-蛋白质相互作用。WDR19突变导致IFT-A功能异常,影响纤毛信号通路,进而导致多种纤毛病。