WHRN基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
WHRN基因编码whirlin蛋白，是听觉毛细胞 stereocilia 发育和维持的关键蛋白，其突变导致非综合征性听力损失和 Usher 综合征。
基因信息卡
| 基因符号 | WHRN |
|---|---|
| 基因全名 | whirlin |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 9q32 |
| NCBI Gene ID | 25861 ncbi.nlm.nih.gov/gene/25861 |
| Ensembl ID | ENSG00000136718 |
| UniProt ID | Q9P202 |
| OMIM ID | 607928 |
| HGNC ID | 16356 |
| 基因别名 | DFNB31; USH2D; RP31 |
基因功能与研究简介
WHRN基因编码whirlin蛋白，该蛋白是Usher蛋白网络的重要组成部分，参与内耳毛细胞静纤毛（stereocilia）的发育、伸长和维持。whirlin蛋白含有PDZ结构域、proline-rich区域和harmonin homology domain，与多种Usher综合征相关蛋白（如USH2A、VLGR1）相互作用，对听觉和视觉功能至关重要。WHRN基因突变可导致常染色体隐性遗传的非综合征性听力损失（DFNB31）以及Usher综合征2型（USH2D），后者表现为听力损失和视网膜色素变性。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 非综合征性听力损失DFNB31 | WHRN基因纯合或复合杂合突变导致听力损失，通常为先天性或早发性，程度为重度至极重度。 | 已明确致病 |
| Usher综合征2型（USH2D） | WHRN基因突变导致USH2D，表现为先天性听力损失和进行性视网膜色素变性。 | 已明确致病 |
| 视网膜色素变性（非综合征性） | 部分WHRN突变（如p.R781H）与常染色体隐性遗传视网膜色素变性（RP31）相关，但听力正常。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 内耳（耳蜗） | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| IMR-90 | 暂无可靠数据 | 成纤维细胞 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.826C>T (p.R276X) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2386C>T (p.R796W) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白相互作用 |
| c.2343delA (p.T781fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
无义突变、移码突变等导致蛋白截短或降解，功能丧失，是WHRN相关疾病的主要机制。
Gain of Function（功能获得，GOF）
暂无明确证据。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
暂无明确证据。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0005912 (adherens junction) |
| • GO:0032420 (stereocilium) | • GO:0007605 (sensory perception of sound) |
| • GO:0007601 (visual perception) |
相关通路
• Usher syndrome pathway (KEGG: hsa05116)
• Stereocilium assembly (Reactome: R-HSA-9658195)
蛋白质功能简介
whirlin蛋白由WHRN基因编码，包含3个PDZ结构域、一个proline-rich区域和一个harmonin homology domain。该蛋白是Usher蛋白网络的核心成员，与USH2A、VLGR1等蛋白相互作用，在听觉毛细胞静纤毛的发育和维持中发挥关键作用。whirlin蛋白还参与视网膜感光细胞的结构维持。
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