XRCC4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

XRCC4是DNA双链断裂非同源末端连接修复通路的核心因子,对维持基因组稳定性至关重要。

基因信息卡

基因符号 XRCC4
基因全名 X-ray repair cross complementing 4
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 5q14.2
NCBI Gene ID 7518 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7518
Ensembl ID ENSG00000152422
UniProt ID Q13426
OMIM ID 194363
HGNC ID 12829
基因别名 X-ray repair cross-complementing protein 4; DNA repair protein XRCC4

基因功能与研究简介

XRCC4基因编码一种关键DNA修复蛋白,在非同源末端连接(NHEJ)通路中作为核心支架蛋白,与DNA连接酶IV(LIG4)形成复合物,促进DNA双链断裂(DSB)的修复。该蛋白还参与V(D)J重组,对免疫系统发育至关重要。XRCC4功能缺失或突变可导致基因组不稳定,与免疫缺陷、发育异常及癌症易感性相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
免疫缺陷伴发育迟缓 XRCC4突变导致NHEJ修复缺陷,影响V(D)J重组,导致B/T细胞发育障碍,表现为免疫缺陷、生长迟缓等。 已明确致病
癌症易感性 XRCC4突变或表达异常导致DNA修复缺陷,增加基因组不稳定,与多种癌症(如白血病、淋巴瘤)风险增加相关。 具有较强研究证据
神经发育异常 部分XRCC4突变患者出现小头畸形、智力障碍等神经发育异常,可能与DNA修复缺陷影响神经发育有关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
胸腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.139C>T (p.Arg47Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,丧失功能
c.244C>T (p.Arg82Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,丧失功能
c.503G>A (p.Trp168Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致XRCC4蛋白功能丧失或减弱,影响NHEJ修复效率。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明XRCC4存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明XRCC4突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006303 - double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0006310 - DNA recombination
• GO:0005634 - nucleus • GO:0005515 - protein binding

相关通路

Nonhomologous end-joining (NHEJ) pathway (Reactome: R-HSA-5693567)
DNA Double-Strand Break Repair (KEGG: hsa03450)

蛋白质功能简介

XRCC4蛋白由334个氨基酸组成,包含N端球状结构域和C端卷曲螺旋结构域。它作为支架蛋白,与LIG4和XLF等蛋白相互作用,稳定DNA连接酶IV并促进其活性。XRCC4在NHEJ修复中发挥核心作用,对维持基因组稳定性至关重要。

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