XRCC6基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
XRCC6编码Ku70蛋白,是DNA双链断裂修复的关键因子,参与V(D)J重组和端粒维持,其突变与免疫缺陷和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | XRCC6 |
|---|---|
| 基因全名 | X-ray repair cross complementing 6 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 22q13.2 |
| NCBI Gene ID | 2547 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2547 |
| Ensembl ID | ENSG00000196419 |
| UniProt ID | P12956 |
| OMIM ID | 601364 |
| HGNC ID | 12835 |
| 基因别名 | Ku70; ML8; CTC75; CTCBF; G22P1 |
基因功能与研究简介
XRCC6基因编码Ku70蛋白,是Ku异二聚体(Ku70/Ku80)的组成部分,在DNA双链断裂修复的非同源末端连接(NHEJ)途径中发挥核心作用。Ku70参与DNA损伤感知、修复复合物组装,并参与V(D)J重组、端粒维持和转录调控。XRCC6功能缺失或突变可导致DNA修复缺陷,与免疫缺陷、发育异常及多种癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 重症联合免疫缺陷 | XRCC6突变导致NHEJ缺陷,影响V(D)J重组,导致T/B细胞发育障碍 | 已明确致病 |
| 生长迟缓伴智力发育障碍 | XRCC6突变影响DNA修复和神经发育 | 已明确致病 |
| 癌症易感性 | XRCC6突变或表达异常影响基因组稳定性,增加癌症风险 | 具有较强研究证据 |
| 自身免疫性疾病 | XRCC6多态性与系统性红斑狼疮等自身免疫病相关 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性粒细胞白血病细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.263G>A (p.Trp88Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.1422_1423del (p.Glu474AspfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.1135C>T (p.Arg379Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.1556A>G (p.Tyr519Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响待研究 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致Ku70蛋白表达减少或功能丧失,影响NHEJ修复,导致基因组不稳定。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明XRCC6存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明XRCC6突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 (DNA binding) | • GO:0003684 (damaged DNA binding) |
| • GO:0006303 (double-strand break repair via nonhomologous end joining) | • GO:0006310 (V(D)J recombination) |
| • GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0000785 (chromatin) | • GO:0006302 (double-strand break repair) |
| • GO:0006304 (DNA repair) | • GO:0006310 (V(D)J recombination) |
相关通路
• Non-homologous end joining (NHEJ) (WP4555)
• DNA Double-Strand Break Repair (WP531)
• V(D)J recombination (WP4490)
• Telomere maintenance (WP531)
蛋白质功能简介
Ku70蛋白(XRCC6)是Ku异二聚体的70 kDa亚基,与Ku80形成复合物,在DNA双链断裂修复中作为损伤传感器,招募DNA-PKcs等修复因子。Ku70还参与端粒维持、转录调控和细胞凋亡。其结构包含N端α/β结构域、中央β-桶结构域和C端臂结构域,负责DNA结合和蛋白相互作用。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|