XRCC6基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

XRCC6编码Ku70蛋白,是DNA双链断裂修复的关键因子,参与V(D)J重组和端粒维持,其突变与免疫缺陷和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 XRCC6
基因全名 X-ray repair cross complementing 6
基因类型 protein-coding
染色体位置 22q13.2
NCBI Gene ID 2547 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2547
Ensembl ID ENSG00000196419
UniProt ID P12956
OMIM ID 601364
HGNC ID 12835
基因别名 Ku70; ML8; CTC75; CTCBF; G22P1

基因功能与研究简介

XRCC6基因编码Ku70蛋白,是Ku异二聚体(Ku70/Ku80)的组成部分,在DNA双链断裂修复的非同源末端连接(NHEJ)途径中发挥核心作用。Ku70参与DNA损伤感知、修复复合物组装,并参与V(D)J重组、端粒维持和转录调控。XRCC6功能缺失或突变可导致DNA修复缺陷,与免疫缺陷、发育异常及多种癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
重症联合免疫缺陷 XRCC6突变导致NHEJ缺陷,影响V(D)J重组,导致T/B细胞发育障碍 已明确致病
生长迟缓伴智力发育障碍 XRCC6突变影响DNA修复和神经发育 已明确致病
癌症易感性 XRCC6突变或表达异常影响基因组稳定性,增加癌症风险 具有较强研究证据
自身免疫性疾病 XRCC6多态性与系统性红斑狼疮等自身免疫病相关 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 高表达
淋巴结 暂无可靠数据 高表达
脾脏 暂无可靠数据 高表达
胸腺 暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
卵巢 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.263G>A (p.Trp88Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.1422_1423del (p.Glu474AspfsTer5) 移码突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.1135C>T (p.Arg379Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.1556A>G (p.Tyr519Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能影响待研究
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致Ku70蛋白表达减少或功能丧失,影响NHEJ修复,导致基因组不稳定。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明XRCC6存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明XRCC6突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 (DNA binding) • GO:0003684 (damaged DNA binding)
• GO:0006303 (double-strand break repair via nonhomologous end joining) • GO:0006310 (V(D)J recombination)
• GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0000785 (chromatin) • GO:0006302 (double-strand break repair)
• GO:0006304 (DNA repair) • GO:0006310 (V(D)J recombination)

相关通路

Non-homologous end joining (NHEJ) (WP4555)
DNA Double-Strand Break Repair (WP531)
V(D)J recombination (WP4490)
Telomere maintenance (WP531)

蛋白质功能简介

Ku70蛋白(XRCC6)是Ku异二聚体的70 kDa亚基,与Ku80形成复合物,在DNA双链断裂修复中作为损伤传感器,招募DNA-PKcs等修复因子。Ku70还参与端粒维持、转录调控和细胞凋亡。其结构包含N端α/β结构域、中央β-桶结构域和C端臂结构域,负责DNA结合和蛋白相互作用。

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