YTHDC2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

YTHDC2是RNA m6A修饰的关键阅读器,参与RNA代谢和精子发生,与男性不育和肿瘤发生相关。

基因信息卡

基因符号 YTHDC2
基因全名 YTH domain containing 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q22.2
NCBI Gene ID 64848 ncbi.nlm.nih.gov/gene/64848
Ensembl ID ENSG00000047188
UniProt ID Q9H6S0
OMIM ID 616530
HGNC ID 24742
基因别名 DC2, YTHDC2

基因功能与研究简介

YTHDC2(YTH domain containing 2)是YTH结构域蛋白家族成员,作为RNA m6A修饰的阅读器,识别并结合含有N6-甲基腺嘌呤(m6A)的RNA,参与RNA的剪接、翻译、稳定性调控等代谢过程。YTHDC2在睾丸中高表达,对精子发生至关重要。此外,YTHDC2在多种肿瘤中表达异常,与肿瘤发生发展相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
男性不育 YTHDC2突变导致精子发生障碍,引起无精子症或少精子症 已明确致病
肝细胞癌 YTHDC2表达下调与肝癌预后不良相关,可能通过影响RNA代谢促进肿瘤进展 具有较强研究证据
结直肠癌 YTHDC2表达异常与结直肠癌的发生发展相关,可能作为肿瘤抑制因子 具有较强研究证据
肾透明细胞癌 YTHDC2表达水平与肾癌患者生存期相关,可能参与肿瘤调控 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
结肠 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
786-O 暂无可靠数据 肾癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1567A>G (p.Thr523Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.2345del (p.Leu782fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致YTHDC2蛋白功能丧失或减弱,影响RNA代谢和精子发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 RNA binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0005737 cytoplasm • GO:0006397 mRNA processing
• GO:0007283 spermatogenesis

相关通路

m6A mRNA methylation pathway
Spermatogenesis pathway

蛋白质功能简介

YTHDC2蛋白包含YTH结构域,能够特异性识别RNA上的m6A修饰。该蛋白在细胞核和细胞质中均有分布,参与mRNA的剪接、翻译和稳定性调控。在睾丸中高表达,对精子发生至关重要。此外,YTHDC2可能通过调控RNA代谢影响肿瘤发生发展。

相关产品

产品名称 货号 物种 基因 ID
YTHDC2基因敲除HEK293细胞 EDJ-KQ16172 64848 详情 立即询价
YTHDC2基因敲除HCT116细胞 EDJ-KQ47385 64848 详情 立即询价
YTHDC2基因敲除A549细胞 EDJ-KQ47384 64848 详情 立即询价
YTHDC2基因敲除Hela细胞 EDJ-KQ47386 64848 详情 立即询价
Displaying Records 1 To 4 Of 4 Records
联系我们
*
*
*
来源:
service online

  • 留言
  • You can send email to contact us.
    邮箱
  • You can send email to contact us.
    电话
    联系电话
    中国总部
    18102225074(微信同号)

  •  回到顶部