ZEB2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ZEB2是调控上皮-间质转化(EMT)的关键转录因子,其突变导致Mowat-Wilson综合征,并与多种癌症的侵袭转移密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ZEB2 |
|---|---|
| 基因全名 | zinc finger E-box binding homeobox 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q22.3 |
| NCBI Gene ID | 9839 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9839 |
| Ensembl ID | ENSG00000169554 |
| UniProt ID | O60315 |
| OMIM ID | 605802 |
| HGNC ID | 14881 |
| 基因别名 | ZFHX1B, SIP1, SMADIP1, KIAA0569 |
基因功能与研究简介
ZEB2(zinc finger E-box binding homeobox 2)基因编码一种转录因子,属于ZEB家族。该蛋白包含两个锌指结构域和一个同源结构域,能够结合E-box序列,抑制或激活靶基因的转录。ZEB2是上皮-间质转化(EMT)的关键调控因子,通过抑制上皮标志物(如E-cadherin)的表达,促进间质标志物的表达,从而在胚胎发育、组织纤维化和肿瘤转移中发挥重要作用。ZEB2的杂合突变导致Mowat-Wilson综合征,一种以先天性巨结肠、智力障碍和特殊面容为特征的神经嵴病。此外,ZEB2在多种癌症中高表达,与肿瘤侵袭、转移和不良预后相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Mowat-Wilson综合征 | ZEB2基因杂合突变导致单倍剂量不足,影响神经嵴细胞发育,导致先天性巨结肠、智力障碍、特殊面容等。 | 已明确致病 |
| 结直肠癌 | ZEB2高表达促进EMT,增强肿瘤侵袭和转移能力,与不良预后相关。 | 癌症相关 |
| 乳腺癌 | ZEB2在乳腺癌中高表达,促进EMT和干细胞特性,与转移和耐药相关。 | 癌症相关 |
| 肝细胞癌 | ZEB2表达上调与肿瘤侵袭、转移和复发相关,可能通过EMT机制。 | 癌症相关 |
| 肺腺癌 | ZEB2表达与上皮-间质转化标志物相关,可能促进肿瘤进展。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2083C>T (p.Arg695*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,单倍剂量不足 |
| c.2764C>T (p.Arg922*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,单倍剂量不足 |
| c.3202C>T (p.Arg1068*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,单倍剂量不足 |
| c.2230C>T (p.Arg744*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,单倍剂量不足 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):ZEB2突变导致蛋白功能丧失或单倍剂量不足,是Mowat-Wilson综合征的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明ZEB2存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明ZEB2突变具有显性负性效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity |
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0006355 regulation of transcription | • DNA-templated |
| • GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II | • GO:0007165 signal transduction |
| • GO:0010628 positive regulation of gene expression | • GO:0010629 negative regulation of gene expression |
| • GO:0010718 positive regulation of epithelial to mesenchymal transition | • GO:0030154 cell differentiation |
| • GO:0045892 negative regulation of transcription | • DNA-templated |
| • GO:0045893 positive regulation of transcription | • DNA-templated |
| • GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II | • GO:0061053 somite development |
相关通路
• Epithelial to mesenchymal transition (EMT) pathway
• TGF-beta signaling pathway
• Wnt signaling pathway
• Hippo signaling pathway
蛋白质功能简介
ZEB2蛋白是一种转录因子,包含N端锌指结构域、同源结构域和C端锌指结构域。它通过结合靶基因启动子中的E-box序列,招募共抑制因子(如CtBP)或共激活因子,从而调控基因表达。ZEB2是EMT的关键诱导因子,抑制上皮标志物(如CDH1)的表达,同时激活间质标志物(如VIM)。在发育过程中,ZEB2对神经嵴细胞的分化和迁移至关重要。在癌症中,ZEB2的异常高表达促进肿瘤细胞侵袭和转移,并与化疗耐药相关。