ZIC3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

ZIC3基因编码锌指转录因子,在早期胚胎发育中发挥关键作用,其突变与内脏异位和先天性心脏病相关。

基因信息卡

基因符号 ZIC3
基因全名 ZIC family member 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 Xq26.3
NCBI Gene ID 7547 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7547
Ensembl ID ENSG00000156925
UniProt ID Q96N20
OMIM ID 300265
HGNC ID 12874
基因别名 ZIC3, HTX1, ZNF203

基因功能与研究简介

ZIC3基因编码一种锌指转录因子,属于ZIC家族,在早期胚胎发育中表达,参与体轴形成、神经管发育和心脏左右不对称性建立。ZIC3突变可导致X连锁的内脏异位(heterotaxy)和先天性心脏病,是内脏异位最常见的遗传病因之一。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
内脏异位 ZIC3突变导致左右轴形成异常,引起内脏器官位置异常,常伴有先天性心脏病。 已明确致病
先天性心脏病 ZIC3突变可导致多种心脏畸形,如大动脉转位、室间隔缺损等。 已明确致病
X连锁内脏异位 ZIC3是X连锁内脏异位的主要致病基因,男性患者症状较重。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
H1人胚胎干细胞 暂无可靠数据 分化早期表达
H9人胚胎干细胞 暂无可靠数据 分化早期表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1000C>T (p.Arg334Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1183C>T (p.Arg395Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1227delC (p.Pro410LeufsTer2) 移码突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

ZIC3功能缺失突变导致蛋白截短或降解,丧失转录激活功能,影响下游靶基因表达,导致左右轴形成异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity
• GO:0005634 nucleus • GO:0007275 multicellular organism development
• GO:0009952 anterior/posterior pattern specification • GO:0007368 determination of left/right symmetry

相关通路

Pathway: Wnt signaling pathway (P00057)
Pathway: Hedgehog signaling pathway (P00025)

蛋白质功能简介

ZIC3蛋白包含五个锌指结构域,属于C2H2型锌指蛋白。在胚胎发育中,ZIC3作为转录因子调控多个基因的表达,参与左右轴建立和神经管闭合。ZIC3突变导致蛋白功能丧失,影响下游信号通路,导致内脏异位和先天性心脏病。

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