ZNF143基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ZNF143是一种序列特异性DNA结合蛋白,作为转录因子调控多种基因表达,参与细胞增殖、分化及基因组稳定性维持,与多种癌症和发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ZNF143 |
|---|---|
| 基因全名 | zinc finger protein 143 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11p15.4 |
| NCBI Gene ID | 7702 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7702 |
| Ensembl ID | ENSG00000166478 |
| UniProt ID | P52747 |
| OMIM ID | 603745 |
| HGNC ID | 13091 |
| 基因别名 | hZNF143, SBF-1, STAF, ZNF143L |
基因功能与研究简介
ZNF143(zinc finger protein 143)编码一种含锌指结构的转录因子,属于STAF家族。该蛋白能够结合特定的DNA序列(如GCCATATA),激活或抑制下游基因的转录。ZNF143在多种组织中表达,参与细胞周期调控、DNA损伤修复、核糖体生物发生等过程。研究表明,ZNF143在多种癌症中表达异常,可能作为癌基因或抑癌基因发挥作用。此外,ZNF143还参与胚胎发育和神经系统功能。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | ZNF143在多种癌症中表达上调或下调,可能通过调控细胞增殖、凋亡和转移相关基因影响肿瘤发生发展。 | 较强研究证据 |
| 神经发育异常 | ZNF143突变与智力障碍和发育迟缓相关,可能通过影响神经元基因表达导致神经发育异常。 | 潜在关联 |
| 免疫缺陷 | ZNF143参与免疫细胞分化,其异常可能与免疫缺陷相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性髓系白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响DNA结合能力,导致功能改变 |
| c.1567C>T (p.Arg523Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
| c.789_790del (p.Glu264fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变(Loss of Function):无义突变、移码突变等导致蛋白截短或降解,使ZNF143失去转录调控功能,可能影响细胞增殖和分化。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得突变(Gain of Function):目前暂无明确证据表明ZNF143存在功能获得突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变(Dominant Negative):目前暂无明确证据表明ZNF143存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0006355 regulation of transcription |
| • DNA-templated | • GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II |
相关通路
• Pathway: hsa04068 FoxO signaling pathway
• Pathway: hsa04110 Cell cycle
• Pathway: hsa04218 Cellular senescence
蛋白质功能简介
ZNF143蛋白由625个氨基酸组成,包含7个C2H2型锌指结构域,位于蛋白中部,负责特异性识别DNA序列。蛋白的N端和C端含有转录激活或抑制结构域。ZNF143在细胞核内形成同源二聚体,结合靶基因启动子区域,招募共激活因子或共抑制因子,调控基因转录。该蛋白在多种组织中表达,参与细胞周期、DNA修复、核糖体生物发生等关键过程。