ZNHIT1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

ZNHIT1是染色质重塑复合物SRCAP的重要亚基,参与组蛋白H2A.Z的沉积,调控基因表达和DNA损伤修复,与神经发育和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 ZNHIT1
基因全名 zinc finger HIT-type containing 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 7q22.1
NCBI Gene ID 10467 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10467
Ensembl ID ENSG00000106462
UniProt ID O43257
OMIM ID 618735
HGNC ID 13205
基因别名 ZNHIT1, CGBP, p18, ZNFN4A1

基因功能与研究简介

ZNHIT1(zinc finger HIT-type containing 1)基因编码一种含有HIT型锌指结构的蛋白质,是染色质重塑复合物SRCAP(Snf2-related CREBBP activator protein)的亚基之一。ZNHIT1参与组蛋白变体H2A.Z在染色质中的沉积,从而调控基因转录、DNA损伤修复和基因组稳定性。该基因在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。ZNHIT1功能异常与神经发育障碍和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 ZNHIT1突变可能导致SRCAP复合物功能异常,影响H2A.Z沉积,进而干扰神经发育相关基因的表达。 ClinVar收录致病性变异,OMIM关联
癌症 ZNHIT1在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响染色质重塑和基因组稳定性参与肿瘤发生。 COSMIC数据库记录体细胞突变,研究证据较强

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达(GTEx)
睾丸 暂无可靠数据 高表达(GTEx)
心脏 暂无可靠数据 中等表达(GTEx)
肝脏 暂无可靠数据 中等表达(GTEx)
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1?) 错义 罕见 可能影响翻译起始,导致功能丧失
c.200C>T (p.Pro67Leu) 错义 罕见 可能影响蛋白质结构,功能未知
c.345del (p.Gln116Serfs*23) 移码 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码或无义突变,导致ZNHIT1蛋白缺失或截短,影响SRCAP复合物功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明ZNHIT1存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

目前暂无明确证据表明ZNHIT1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003676 (nucleic acid binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006338 (chromatin remodeling) • GO:0006281 (DNA repair)
• GO:0042393 (histone binding)

相关通路

SRCAP complex pathway (Reactome: R-HSA-5250913)
Chromatin modifying enzymes (Reactome: R-HSA-3247509)

蛋白质功能简介

ZNHIT1蛋白含有HIT型锌指结构域,分子量约18 kDa。作为SRCAP复合物的亚基,ZNHIT1参与将组蛋白变体H2A.Z沉积到染色质中,从而影响基因转录调控和DNA损伤修复。该蛋白在细胞核中定位,与染色质重塑和基因组稳定性密切相关。

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